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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004655`

染色体: Chr01 坐标: 64653899-64654787 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004655`
名称	SmilChr01G004655
描述	EG45-like domain containing protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64653899 - 64654787 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005005`
GeneID	`131005005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005005`
原始查询	`SmilChr01G004655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	EG45-like domain containing protein
产物	EG45-like domain containing protein
Arabidopsis	`AT4G30380` (AT4G30380) Barwin-related endoglucanase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829161] identity=40.8; qcov=0.938; evalue=1.05e-27; confidence=medium
Rice	`Os09g0472900` - identity=57.1; qcov=0.875; evalue=4.32e-43; confidence=medium
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0009627 (systemic acquired resistance); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057787764.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057787764.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64654232`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C59
`Chr1:64654232`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C59
`Chr1:64654246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64654592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787764.1

128 aa

128

DPBB_1

PF03330 DPBB_1 49-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787764.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	49	125	3.1e-19	69.7	Lytic transglycolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931781.1
AAACTTGTATAAATAGAGCCACATTTCCAACCAAATATGCAAGAGAAGCAAGCTTAAATCTTCTGTGAGATTATATTATATTATATACATACAACCTAAATTAAAAATGGGTTTGGCAAGAATGATTATGTTGGCAGTTGCTGCAGCTAGCATGATTTCCATGGCATCTGCCATCGCTGGAACCGCCACTTACTACAGCCCCATCGTCCCATCATCATGCTACGGGTATGAAGACAAAGGCACGATGGTAGCAGCTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005005
ATGGGTTTGGCAAGAATGATTATGTTGGCAGTTGCTGCAGCTAGCATGATTTCCATGGCATCTGCCATCGCTGGAACCGCCACTTACTACAGCCCCATCGTCCCATCATCATGCTACGGGTATGAAGACAAAGGCACGATGGTAGCAGCTGCAAATCCTGCGCTCTTCAACAACCGTGCAGCCTGTGGGCAGAGATACACAGTCCGGTGCACCGGAGCCACAAACCAAGGCGTGCCGCAGCCGTGCCGCAACGGCCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787764.1
MGLARMIMLAVAAASMISMASAIAGTATYYSPIVPSSCYGYEDKGTMVAAANPALFNNRAACGQRYTVRCTGATNQGVPQPCRNGPITVTIVDLCPGCAANQIDLSEQAFNAIADPNAGRILIDYNRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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