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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004659`

染色体: Chr01 坐标: 64676701-64678770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004659`
名称	SmilChr01G004659
描述	RING-H2 finger protein ATL13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64676701 - 64678770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005009`
GeneID	`131005009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005009`
原始查询	`SmilChr01G004659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL13-like
产物	RING-H2 finger protein ATL13-like
Arabidopsis	`AT4G30400` (AT4G30400) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829163] identity=49.9; qcov=1.1; evalue=1.42e-104; confidence=high
Rice	`Os08g0445000` - identity=47.9; qcov=1; evalue=1.44e-111; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787768.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787768.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787768.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787768.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64677092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:64677827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64677848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:64678181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787768.1

455 aa

228

455

zf-rbx1

zf-ANAPC11

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

PF12678 zf-rbx1 124-169 aa PF12861 zf-ANAPC11 124-172 aa PF17123 zf-RING_11 126-155 aa PF13639 zf-RING_2 126-169 aa PF00097 zf-C3HC4 127-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787768.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	124	169	1.2e-09	39.0	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057787768.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	124	172	2.2e-07	31.6	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger
`XP_057787768.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	126	155	8.4e-10	38.9	RING-like zinc finger
`XP_057787768.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	126	169	2e-14	54.3	Ring finger domain
`XP_057787768.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	127	168	0.00027	21.5	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931785.1
TAAATAAATAAATTTGGATTTAGGAGACTTAAATGTGCATTGGGTTCATGAGATGGGGTTCATTTTTTCCAAGTCAACCCAGCTCTAGTTTTTTGCATTATTTTAGTAGGGTGGCATTGGATTTGAGTAGCATTTTAATTTTCTTGGGGTTAATTAGATCCAATATTAATGGGGTGCTGTTGTTCGATTTATTGTAGCCAATTCAAATCTTTACCTTCTCTGCGACACATTTATTTCTCTTTCATCAATTTTTCTTGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005009
ATGAGGTGGGAAAGCAAAGAAAAATCGTTTGTTTCTCCCTCCCAACAGCCATACTTTATGTTTGTGTCTCCTCCACCCCCTCTGCCAGCCTCACAGTCAGATGGGTTCAACTTGAACAACAAGGTGAGTCCGAGTATGCTGCTGATAATCATAATCTTAGCAATCATCTTCTTCATTTCTGGGTTGCTACATCTTCTTGTAAGATTTCTGTTGAGGCCTCCAAATAGGGATCCTGATGAAATGGACGATGTGACCGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787768.1
MRWESKEKSFVSPSQQPYFMFVSPPPPLPASQSDGFNLNNKVSPSMLLIIIILAIIFFISGLLHLLVRFLLRPPNRDPDEMDDVTALQGQLQQLFNLHDAGVDQSFIDTLPVFDYNAIIGVKDPFDCAVCLCEFEADDKLRLLPKCSHAFHMDCIDTWLLSHSTCPICRASLLQDFPLNNTRSPIVLVLESGSESSREIVSDREASVARVNSHLSDGLFPRAEIVSGEIEANEEDRSKKVVSVKLGKFKNVEGGGEGSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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