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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004666`

染色体: Chr01 坐标: 64779154-64781375 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004666`
名称	SmilChr01G004666
描述	tetraspanin-8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64779154 - 64781375 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005017`
GeneID	`131005017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005017`
原始查询	`SmilChr01G004666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-8-like
产物	tetraspanin-8-like
Arabidopsis	`AT2G23810` (TET8) tetraspanin8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816913] identity=71.3; qcov=1; evalue=6.66e-136; confidence=high
Rice	`Os09g0425900` (OsSAP) - identity=64.1; qcov=0.989; evalue=1.3e-119; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787783.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787783.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787783.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787783.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64779558`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B83
`Chr1:64779558`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B83
`Chr1:64779713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:64780520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B123,C1
`Chr1:64780601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C1
`Chr1:64780674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:64780829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B105,B75,B81
`Chr1:64780909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787783.1

265 aa

132

265

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 5-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787783.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	5	251	5.3e-40	138.2	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931800.1
GAGAAAAGGAAAGTGAAAAATGAAAATAGACGGCGTGAGAAATAAAAGCCGTCGCGCTTTGCTACACGAATCGTTGACCGCTACATGCCACCAAAGCTGGGGCCCAGAGTATCCGTTAGTTTAAAGTGAAAAGCTTTTATCTATCACAATTTGCCGAAACAATTTCTATCTTCGCGTCGCTGCGGTAAGAGAGACAGCGAGTATAGCTATTAAACGCTACTCTCAAAATTGTACACGACACCTCCCCACTCGCCAACGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005017
ATGCGCGTGAGCAACAATCTGGTAGGAATTCTGAACTTCGTGACGCTACTGCTTTCGATTCCGATAATCGGCGGCGGGATATGGCTGTCGAAGCAGGCGGACACGGATTGCGAGCGATTCCTGGACACGCCGGTGATCGTGCTGGGGGTGTTCGTGCTGCTCGTGTCTATCGCGGGGCTGGTGGGGTCCTGCTGCCGCGTCACGTGGCTGCTGTGGGTGTACCTGCTCGTGATGTTTCTGTTGATCCTGCTGCTCTTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787783.1
MRVSNNLVGILNFVTLLLSIPIIGGGIWLSKQADTDCERFLDTPVIVLGVFVLLVSIAGLVGSCCRVTWLLWVYLLVMFLLILLLFCFTIFAFVVTNKGAGKAVSDRGYKEYRLGDYSNWLQKRVNGNWGKIRSCLEDSKVCQKLLAAGSTPVTEFYKEHLSALQSGCCKPSDDCNFQYISPTNWTSSATPTSPNPDCAKWSNEPNKLCYECDSCKAGLLDNIKSDWKKVAVINIVFLVFLVIVYTVGCCAFRNNREDHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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