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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004667`

染色体: Chr01 坐标: 64786058-64788801 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004667`
名称	SmilChr01G004667
描述	cytochrome c oxidase subunit 6b-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64786058 - 64788801 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005019`
GeneID	`131005019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005019`
原始查询	`SmilChr01G004667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase subunit 6b-2-like
产物	cytochrome c oxidase subunit 6b-2-like
Arabidopsis	`AT5G57815` (AT5G57815) Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835891] identity=88; qcov=0.974; evalue=5.82e-48; confidence=medium
Rice	`Os03g0390400` (OsCOX6b1) - identity=86.7; qcov=0.974; evalue=3e-49; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0045277 (respiratory chain complex IV)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02297 (COX6B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057787788.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057787786.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057787788.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057787789.1`
5	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057787789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64786226`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A11,A25,A7,B103,B107,B110,B114,B118,B121,B125,B129,B131,B132,B16,B17,B25,B28,B3,B46,B5,B51,B54,B59,B77,B84,B88,B90,B92,C13,C16,C18,C20,C3,C36,C37,C38,C46,C59,C60,C70,C73,C75,D10,D6,D7
`Chr1:64786332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:64787172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D2
`Chr1:64787991`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	96	A14,A19,A25,A5,A8,A9,B10,B101,B103,B108,B112,B113,B115,B117,B119,B120,B123,B124,B126,B128,B129,B13,B130,B135,B138,B139,B18,B19,B2,B21,B22,B28,B29,B30,B32,B33,B35,B38,B39,B40,B47,B49,B52,B53,B58,B6,B63,B65,B70,B71,B72,B74,B76,B78,B79,B82,B84,B86,B91,B93,B99,C1,C15,C16,C19,C2,C21,C23,C24,C27,C31,C32,C33,C39,C4,C42,C45,C48,C50,C52,C57,C58,C61,C62,C65,C68,C70,C74,C75,C78,C79,C8,C86,D1,D4,D5
`Chr1:64788193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:64788228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B123,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787788.1

91 aa

COX6B

PF02297 COX6B 28-88 aa

XP_057787789.1

77 aa

COX6B

PF02297 COX6B 14-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787788.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	28	88	2.1e-22	79.8	Cytochrome oxidase c subunit VIb
`XP_057787789.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	14	74	1.2e-22	80.5	Cytochrome oxidase c subunit VIb

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931806.1
GATACATCCGCTTTGGCCTGCGGACTGATCCACGTGTACGGTGCGGCTAGCGAACTGGACGAACCGCACCGAAATAACCGTTTAATTATTTCTCAATTAGTCCCGTTCATACTGGTGGGTAAAGATTGAAACTGAAAATACGAAGCAACAACTTTTGAATTTCACCCGCTGAAAATTTCTGATTCCGATGGCCGAGATTGAACTTAAAACCGCACCAGCTGATTTTCGATTCCCCACTACCAATCAAACCCGGCATTGTT...

XM_057931804.1
CCTGCGGACTGATCCACGTGTACGGTGCGGCTAGCGAACTGGACGAACCGCACCGAAATAACCGTTTAATTATTTCTCAATTAGTCCCGTTCATACTGGTGGGTAAAGATTGAAACTGAAAATACGAAGCAACAACTTTTGAATTTCACCCGCTGAAAATTTCTGATTCCGATGGCCGAGATTGAACTTAAAACCGCACCAGCTGATTTTCGATTCCCCACTACCAATCAAACCCGGCATTGTTTCACCCGTTACATTGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131005019
ATGGCCGAGATTGAACTTAAAACCGCACCAGCTGATTTTCGATTCCCCACTACCAATCAAACCCGGCATTGTTTCACCCGTTACATTGAGTTCCATAGTGTGGAGAGCTCGCATTGGATGAGCAATGAGACGAGAATAGCCTCTGTGATTCTTATATTTCTTCGTGCGTTGCTGCTAAGGGTGAAGAATATAGTGACTGTGATAAGTTTGCCAAGTACTATCGTTCCCTTTGCCCTGGAGAATGGGTCGAGAAGTGGAAC...

LOC131005019
ATGCATGATGTTGCGATTACTTGGGTTCAATATCTTGATCTTCAGCAAAATATTGAACTTAAAACCGCACCAGCTGATTTTCGATTCCCCACTACCAATCAAACCCGGCATTGTTTCACCCGTTACATTGAGTTCCATAGTGTGGAGAGCTCGCATTGGATGAGCAATGAGACGAGAATAGCCTCTGTGATTCTTATATTTCTTCGTGCGTTGCTGCTAAGGGTGAAGAATATAGTGACTGTGATAAGTTTGCCAAGTAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057787786.1
MHDVAITWVQYLDLQQNIELKTAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEFHSVESSHWMSNETRIASVILIFLRALLLRVKNIVTVISLPSTIVPFALENGSRSGTNRGRMGHFLGLYSVLGHQCLDLLFHHLSEASH

XP_057787787.1
MAEIELKTAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEFHSVESSHWMSNETRIASVILIFLRALLLRVKNIVTVISLPSTIVPFALENGSRSGTNRGRMGHFLGLYSVLGHQCLDLLFHHLSEASH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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