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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004670`

染色体: Chr01 坐标: 64795713-64797067 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004670`
名称	SmilChr01G004670
描述	uncharacterized SmilChr01G004670
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64795713 - 64797067 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005020`
GeneID	`131005020`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005020`
原始查询	`SmilChr01G004670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816383]; symbol=AT2G18680; hit=AT2G18680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816383]; symbol=AT2G18680; hit=AT2G18680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G18680` (AT2G18680) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816383] identity=26.9; qcov=0.896; evalue=5.5e-15; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005020

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057787790.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057787790.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057787790.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057787790.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057787790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64796224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr1:64796291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64796577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:64796579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B83,C5,C59,D11
`Chr1:64796725`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:64796725`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787790.1

307 aa

154

307

DUF8558

PF29520 DUF8558 4-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787790.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	4	238	5.9e-12	46.2	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931807.1
GGTCAAAGTCTTATTGGAGGCTACGTAGCCAATATTTTATTCAAGGAAAACTCCCTTTCAAGTAAAAAAAGTAGATAATTAAACAAGAAGGGAAATTTATTTGGGTTTATTTACGAAGTATACATCTTTTCAAACTCGACCAAGTCAAACAGTCGACAAGTTCAAAAAACTAAGGAATCCAGAAAACATCATCCCTCTAAATATACACACATAGTCGATGCACAAAACCTATTACAACCAACTGAAACCGCCATGATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005020
ATGATGGAATGCTTTCAGTTCTTTAATTTCATCATAATTCTGAAAGATTCCATAAAACTATGTGGCCAAAACTGGAGGTTGATGGCCTTAGTAGCCACACTCTCCATGATCTCTTCTTCAATCTTCTTCTTCATCTTCTCGGCCTCGTCGACCGCGCTCGTGCTCCACGACCTGCTCGTGAAGGAATCCGTGATCCCAATCTTCAGCTCCGTCATCTCCAAAATCATCAGCGACGCCACAGGCGTCACCTCCAACCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787790.1
MMECFQFFNFIIILKDSIKLCGQNWRLMALVATLSMISSSIFFFIFSASSTALVLHDLLVKESVIPIFSSVISKIISDATGVTSNLPPGFVPLYFLITFLSITATVTVSTHSCNGNRLSLKELSTSIVKSWTRPFVTAFYTTVSVVGYEALALYMAIPLLTSSLVSSNVSSRAAAVVYGIAACGLYLYVCGVWIMSLVVSVAEEDGGIAAIGKAAMMMKGRRWDAFLLNVWMNFVVLVGLIAVLGSGGGEIWLVNICCLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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