当前解析结果
SmilChr01G004671| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004671 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004671 |
| 描述 | protein FLX-like 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 64798801 - 64801849 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005021 |
|---|---|
| GeneID | 131005021 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005021 |
| 原始查询 | SmilChr01G004671 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FLX-like 4 |
| 产物 | protein FLX-like 4 |
| Arabidopsis | AT1G67170 (AT1G67170)sarcolemmal membrane-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843037] identity=30.3; qcov=0.876; evalue=3.48e-35; confidence=low |
| Rice | Os04g0479100 (TGO)- identity=39.7; qcov=0.556; evalue=5.73e-41; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005021 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057787791.1 |
| 2 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057787791.1 |
| 3 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057787791.1 |
| 4 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057787791.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057787791.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:64799162 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B98,D10 |
Chr1:64799163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:64799282 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,D7 |
Chr1:64800288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,D2 |
Chr1:64800353 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:64800378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。