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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004675`

染色体: Chr01 坐标: 64846608-64849641 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004675`
名称	SmilChr01G004675
描述	uncharacterized SmilChr01G004675
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64846608 - 64849641 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005025`
GeneID	`131005025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005025`
原始查询	`SmilChr01G004675`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0179100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0179100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G26160` (AT1G26160) Metal-dependent phosphohydrolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839157] identity=77.9; qcov=0.721; evalue=1.92e-83; confidence=high
Rice	`Os02g0179100` - identity=82.4; qcov=0.706; evalue=1.88e-86; confidence=high
GO	GO:0002953 (5'-deoxynucleotidase activity); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01966 (HD); PF12917 (YfbR-like); PF13023 (HD_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057787795.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057787795.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057787796.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787795.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787795.1

236 aa

118

236

YfbR-like

HD_3

PF12917 YfbR-like 55-206 aa PF13023 HD_3 60-216 aa PF01966 HD 82-184 aa

XP_057787796.1

201 aa

100

201

YfbR-like

HD_3

PF12917 YfbR-like 55-190 aa PF13023 HD_3 60-194 aa PF01966 HD 82-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787795.1`	Pfam	`PF12917`	YfbR-like	Family	55	206	2.1e-09	38.1	5'-deoxynucleotidase YfbR-like
`XP_057787795.1`	Pfam	`PF13023`	HD_3	Domain	60	216	1.1e-51	175.8	HD domain
`XP_057787795.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	82	184	7.1e-10	39.9	HD domain
`XP_057787796.1`	Pfam	`PF12917`	YfbR-like	Family	55	190	1.1e-08	35.8	5'-deoxynucleotidase YfbR-like
`XP_057787796.1`	Pfam	`PF13023`	HD_3	Domain	60	194	6.8e-50	169.9	HD domain
`XP_057787796.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	82	184	5.1e-10	40.4	HD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931813.1
ATAGTGAGAATTGGGGAAAGCGCTTATTCCCTCAATCGAAGAGAAAAAAAAGGGGGAAAGAAAAATGAGTAGAGTGATATGCAAATTCATACTATCACCCTCTATCCTTGCTACTCAGCTCCGCTTCGCTTCTCTTTGCACCGCCGCCTCAAGGGCTTCGCGAATGGCGGCTGAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCACCTTCACCTTCCCCTTCCGCCGCCGTCGATTTTCTCACTCTTTGCCACCGTCTCAAGACGACAA...

XM_057931812.1
TAGTGAGAATTGGGGAAAGCGCTTATTCCCTCAATCGAAGAGAAAAAAAAGGGGGAAAGAAAAATGAGTAGAGTGATATGCAAATTCATACTATCACCCTCTATCCTTGCTACTCAGCTCCGCTTCGCTTCTCTTTGCACCGCCGCCTCAAGGGCTTCGCGAATGGCGGCTGAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCACCTTCACCTTCCCCTTCCGCCGCCGTCGATTTTCTCACTCTTTGCCACCGTCTCAAGACGACAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005025
ATGAGTAGAGTGATATGCAAATTCATACTATCACCCTCTATCCTTGCTACTCAGCTCCGCTTCGCTTCTCTTTGCACCGCCGCCTCAAGGGCTTCGCGAATGGCGGCTGAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCACCTTCACCTTCCCCTTCCGCCGCCGTCGATTTTCTCACTCTTTGCCACCGTCTCAAGACGACAAAGCGAGCAGGATGGGTAAAAAGGGGGGTTCAGGAACCAGAATCGATAGCTGATCACATGTATCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787795.1
MSRVICKFILSPSILATQLRFASLCTAASRASRMAAEASSSSSPPSPSPSAAVDFLTLCHRLKTTKRAGWVKRGVQEPESIADHMYRMGLMALIASDNSSVNREKCIKMAIVHDIAEAIVGDITPSDGVPKEEKSRREQEALQKMCELLGGGERAQEIKELWMEYEENSSMEAKVVKDFDKVEMILQALEYENEQGKDLEEFFESTAGKFQTDMGKAWALEIASRRKKHAPNTIPK

XP_057787796.1
MSRVICKFILSPSILATQLRFASLCTAASRASRMAAEASSSSSPPSPSPSAAVDFLTLCHRLKTTKRAGWVKRGVQEPESIADHMYRMGLMALIASDNSSVNREKCIKMAIVHDIAEAIVGDITPSDGVPKEEKSRREQEALQKMCELLGGGERAQEIKELWMEYEENSSMEAKVVKDFDKVEMILQALEYENGERFGRVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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