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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004692`

染色体: Chr01 坐标: 64979087-64979751 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004692`
名称	SmilChr01G004692
描述	uncharacterized SmilChr01G004692
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64979087 - 64979751 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005040`
GeneID	`131005040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005040`
原始查询	`SmilChr01G004692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008173]; symbol=AT4G30845; hit=AT4G30845; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008173]; symbol=AT4G30845; hit=AT4G30845; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G30845` (AT4G30845) DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008173] identity=51.1; qcov=0.756; evalue=9.97e-25; confidence=medium
Rice	`Os03g0210900` - identity=55.6; qcov=0.529; evalue=5.67e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25397 (DUF7887)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057787818.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057787818.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057787818.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787818.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64979139`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,B140
`Chr1:64979151`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,B140
`Chr1:64979151`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A18,B140
`Chr1:64979154`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,B140
`Chr1:64979154`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A18,B140
`Chr1:64979170`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B136,B16
`Chr1:64979170`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B136,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787818.1

119 aa

119

DUF7887

PF25397 DUF7887 54-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787818.1`	Pfam	`PF25397`	DUF7887	Domain	54	113	5e-34	116.5	Domain of unknown function (DUF7887)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931835.1
ATCCCATACCCCCATGAACCCAGAGTATCCTTGCAAATTAAAAGCCAAAGAGAAGGACCAATGCTGACCTCTCAATGCCATGAAAATACAGCAGCCACTCCCACTCACAAAATTAGTAGATAAGAATTTTCAGACCTACATCTAAGATAAGAAGAATGTTCAACCTCGTCTCCTGCACCAAACCTTTTTGTCTGAATTCCAACAGAAATACCAGAAAACAATTTGTGATTTCTCCAGCATTTGCTAAGAAGAAGGAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005040
ATGTTCAACCTCGTCTCCTGCACCAAACCTTTTTGTCTGAATTCCAACAGAAATACCAGAAAACAATTTGTGATTTCTCCAGCATTTGCTAAGAAGAAGGAATATTCTCAAAATTCAACTACACCAAAAAAGACCATTTTCCCATTGAAATTCTTCAGCAGCAAGAATCTCATCATTCAATCTGGTATTGGAGTTTTTGCATTAGGATTCATCGATGCTGGGTATAGTGGAGACTGGTCAAGAATTGGTGTGATTTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787818.1
MFNLVSCTKPFCLNSNRNTRKQFVISPAFAKKKEYSQNSTTPKKTIFPLKFFSSKNLIIQSGIGVFALGFIDAGYSGDWSRIGVISRGTEDLLKAAAFLVVPLCIFLIFFLFENDGYEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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