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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004710`

染色体: Chr01 坐标: 65242854-65245650 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004710`
名称	SmilChr01G004710
描述	uncharacterized SmilChr01G004710
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65242854 - 65245650 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005057`
GeneID	`131005057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005057`
原始查询	`SmilChr01G004710`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822372]; symbol=AT3G27500; hit=AT3G27500; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822372]; symbol=AT3G27500; hit=AT3G27500; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G27500` (AT3G27500) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822372] identity=27.2; qcov=0.91; evalue=2.33e-32; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=30.1; qcov=0.283; evalue=1.48e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057787834.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057787834.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057787834.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787834.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65243424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B50,B95,C13,C49
`Chr1:65243432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:65243474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:65243518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:65243528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:65243691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:65243793`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A2,A22,A24,A7,B103,B112,B113,B114,B12,B126,B132,B138,B139,B16,B18,B22,B26,B27,B31,B32,B33,B34,B35,B41,B5,B51,B54,B56,B58,B59,B6,B65,B71,B74,B75,B77,B85,B93,B94,B96,B99,C10,C11,C18,C2,C20,C22,C26,C27,C3,C31,C32,C33,C35,C40,C41,C47,C51,C52,C55,C62,C64,C66,C68,C69,C71,C72,C75,C78,C8,C82,C9,D8
`Chr1:65243851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B140
`Chr1:65244163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr1:65244187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:65244410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:65244508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787834.1

647 aa

324

647

C1_2

PF03107 C1_2 20-67 aa PF03107 C1_2 77-124 aa PF03107 C1_2 140-186 aa PF03107 C1_2 196-246 aa PF03107 C1_2 527-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787834.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	20	67	1.5e-50	170.0	C1 domain
`XP_057787834.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	77	124	1.5e-50	170.0	C1 domain
`XP_057787834.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	140	186	1.5e-50	170.0	C1 domain
`XP_057787834.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	196	246	1.5e-50	170.0	C1 domain
`XP_057787834.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	527	572	1.5e-50	170.0	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931851.1
TGTAATTGTGTGGTTTGATTTTTCTTTTATAAAATTTTATGTGTGTAACTAATGGCTTCCATCAAAGAGTTTTTACTTGCAAATATATGTTGACCTAACTAGCGTGTTATATTCAAAAAAGAGAAGGCCTATGTCTAAATTCTAATGCAAAGAAAATTATACTTCCTCCAACTTGTTAAGGGATAGTTTTCAAAAAATGAATTTCATACATTTTTATTGGGAGGGTCGACGAAAATAATAATTAAGTATGCATTCTGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005057
ATGAGTGAGAAAGGAAGAGAGATGACAAAGGAGGAAGAGGAGGTGATTCTTGATCATTTCTTGCACGACCATCCACTTGCTCTAACCGAAACTCGCGTGGAAAGCATATGCCACTGCTGTCGGAGGCGCTTCTACGGCGAAGTAGGCTATAGCTGCAGCAAGAAATGCGGCAGCGATTTCGTAATACACGAAGAATGTGCAGAAATGCCGAGAAGCATCACGCATCCCACGCACCCTCCCCAACACACGCTTACCCAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787834.1
MSEKGREMTKEEEEVILDHFLHDHPLALTETRVESICHCCRRRFYGEVGYSCSKKCGSDFVIHEECAEMPRSITHPTHPPQHTLTQTKETWAGECAVCELDMRSEVGYHCSSSGCYFHMHMRCASSMGVMCVAGDDHSMSHPQHQLRSWRRPGRSCSFRCDACGTRQHGSSYVCVACQYWIHESCAALALTAQFPHHQHPLSLDFHFPIEYVMFNFKCDICRKPLLRKHWVYHCRLCRYVVHIKCAITASSVPPNTLDNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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