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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004712`

染色体: Chr01 坐标: 65272557-65278064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004712`
名称	SmilChr01G004712
描述	metal transporter Nramp1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65272557 - 65278064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005059`
GeneID	`131005059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005059`
原始查询	`SmilChr01G004712`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmNRAMP1` CORE-006; 2026	`PP663235`	`LOC131005059` `SmilChr01G004712` GeneID 131005059	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.435%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI
`SmNRAMP1` CORE-006; 2026	`PP663236`	`LOC131005059` `SmilChr01G004712` GeneID 131005059	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.937%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal transporter Nramp1
产物	metal transporter Nramp1
Arabidopsis	`AT1G15960` (NRAMP6) NRAMP metal ion transporter 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838166] identity=74.4; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0676000` (NRAMP3) - identity=71.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0015086 (cadmium ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01566 (Nramp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057787835.1`
2	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.60000	`XP_057787835.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057787835.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057787835.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057787835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65273099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:65274194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,D10,D11
`Chr1:65275179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B55
`Chr1:65275457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,B81
`Chr1:65275529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:65276283`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:65276283`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr1:65277588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B50,B95,C13,C49
`Chr1:65277795`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	68	A1,A10,A16,A20,A21,A22,A5,A6,A9,B10,B103,B109,B115,B119,B120,B123,B127,B136,B137,B14,B2,B20,B24,B37,B45,B49,B51,B52,B53,B55,B57,B6,B63,B68,B7,B80,B86,B87,B9,B91,B97,B98,C15,C16,C20,C21,C23,C30,C33,C35,C37,C4,C42,C44,C45,C5,C56,C58,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C83,C87,D2,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787835.1

530 aa

265

530

Nramp

PF01566 Nramp 51-448 aa

XP_057787836.1

530 aa

265

530

Nramp

PF01566 Nramp 51-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787835.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	51	448	7.7e-132	440.6	Natural resistance-associated macrophage protein-like
`XP_057787836.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	51	448	7.7e-132	440.6	Natural resistance-associated macrophage protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931852.1
ATGGCTCCATATAATTTCCCTTTGTTGAATTTTGTCTTGACTTGGACTTCCCTCTTCTCTCTCTCTCTCACTATACTTTATAAGATGGTGCAGCGGAAGTGTCCAGTTTAAAGTAAACACCTCTGTTACAAAAATTCTTCGAAAACTGTTTCTGTCAAAATAGTTAGGAGAAAATGGCTGCGCCGCCAGTTCAGCCGCAGTTTATGACCACCACCGACCGCAGAACTCATCCCGACGAGTCGCTCATTGATAATATTGAA...

XM_057931853.1
CCTTTGTTGAATTTTGTCTTGACTTGGACTTCCCTCTTCTCTCTCTCTCTCACTATACTTTATAAGATGGTGCAGCGGAAGTGTCCAGTTTAAAGTAAACACCTCTGTTACAAAAATTCTTCGAAAACTGTTTCTGTCAAAATATTCGGTCTGAATTACTCAAACATTAGTAATTGGATCTGGGCAACTCTCTTTCTCTTCACATGCACACTCACGCAATCCTAATTCTACAGCAAGTTAGGAGAAAATGGCTGCGCCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005059
ATGGCTGCGCCGCCAGTTCAGCCGCAGTTTATGACCACCACCGACCGCAGAACTCATCCCGACGAGTCGCTCATTGATAATATTGAATATGATCAGATTGTTGTGCCGGAGAATAAAAGCTGGAAGAACTTGTTTTCATATATCGGCCCAGGGTTTCTTGTTTGCATTGCTTATATTGATCCAGGAAATTTTCAGACGGATCTGCAGGCCGGAGCTCAGTATAAGTATGGACTACTTTGGATCATATTGCTTGCTTCATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787835.1
MAAPPVQPQFMTTTDRRTHPDESLIDNIEYDQIVVPENKSWKNLFSYIGPGFLVCIAYIDPGNFQTDLQAGAQYKYGLLWIILLASCAALIIQSLAANLGVVTGKHLAEHCRKEYPRVPNFILWILAEIAIVACDIPEVIGTAFALNMLFNIPLWCGVLITGLSTLVLLLLQQYGVRKLEIFIAFLVLTIAGCFFAELGYAKPNSSEVLQGLFVPQLKGSGATKLAISLLGAMVMPHNLFLHSALVLSRKIPRSVSGIKE...

XP_057787836.1
MAAPPVQPQFMTTTDRRTHPDESLIDNIEYDQIVVPENKSWKNLFSYIGPGFLVCIAYIDPGNFQTDLQAGAQYKYGLLWIILLASCAALIIQSLAANLGVVTGKHLAEHCRKEYPRVPNFILWILAEIAIVACDIPEVIGTAFALNMLFNIPLWCGVLITGLSTLVLLLLQQYGVRKLEIFIAFLVLTIAGCFFAELGYAKPNSSEVLQGLFVPQLKGSGATKLAISLLGAMVMPHNLFLHSALVLSRKIPRSVSGIKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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