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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004714`

染色体: Chr01 坐标: 65324708-65326861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004714`
名称	SmilChr01G004714
描述	uncharacterized SmilChr01G004714
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65324708 - 65326861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011618`
GeneID	`131011618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011618`
原始查询	`SmilChr01G004714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=28.3; qcov=0.2; evalue=2.15e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795377.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795377.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057795377.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057795377.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057795377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65324712`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B14,C44
`Chr1:65324712`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B14,C44
`Chr1:65324714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B7,C3
`Chr1:65324748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B52,B72
`Chr1:65324903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B51,B65,C1,C58
`Chr1:65325026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A13,A16,A18,B102,B110,B14,B29,B41,B51,B55,B61,B65,B96,C15,C44,C58,C60,C7
`Chr1:65325045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:65325059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C23
`Chr1:65325074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:65325265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:65325300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C72
`Chr1:65325468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795377.1

691 aa

346

691

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 607-685 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795377.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	607	685	1.1e-05	26.8	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939394.1
ATGCCTCGTTCTTCTCGTACAGGCGCATTAGTTTTTGATCCAGAAATCGAGAAGACCGCACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAAATCTAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGATCAAGAAGAAATTGAAGATCCAATGGGTGACCGTAACAATAGGGATGAGGAGAACGATAGAGAGATCGTTGATCCTCGACAGGAACCACCTCAACTGATCAGAGAGTTAGGCCGTCATAGAAGCAATCGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011618
ATGCCTCGTTCTTCTCGTACAGGCGCATTAGTTTTTGATCCAGAAATCGAGAAGACCGCACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAAATCTAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGATCAAGAAGAAATTGAAGATCCAATGGGTGACCGTAACAATAGGGATGAGGAGAACGATAGAGAGATCGTTGATCCTCGACAGGAACCACCTCAACTGATCAGAGAGTTAGGCCGTCATAGAAGCAATCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795377.1
MPRSSRTGALVFDPEIEKTARKLKKQAKEWKKKSNSAPPSLEDQEEIEDPMGDRNNRDEENDREIVDPRQEPPQLIRELGRHRSNRPLCIVLPAINGNAEIRLGFIQVLPKFGDLPGESAHKHLAEFDLVCSTLRPHGFTENNLRLLPFSHTLQGRARDWLFDLPPGSIRTWGDLEEQFLRKFFPESRAANLRMAISSIKQKKAESLADYWERFQQLCRKCPDHGFSDYQLLTNYFYRGMSSFDRKIVDAACGGSLTNKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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