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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004716`

染色体: Chr01 坐标: 65374814-65375152 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004716`
名称	SmilChr01G004716
描述	uncharacterized SmilChr01G004716
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65374814 - 65375152 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011642`
GeneID	`131011642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011642`
原始查询	`SmilChr01G004716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0643433` - identity=39.6; qcov=0.991; evalue=9.25e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795400.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795400.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795400.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795400.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65374813`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A19,A4,B102,B107,B11,B124,B131,B21,B23,B26,B42,B43,B44,B66,B69,B8,C29,C40,C52,C6,C86,D10
`Chr1:65374815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B27,B80
`Chr1:65374833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr1:65374835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:65374839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A14,C1,C23
`Chr1:65374863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B28,C74,D11,D3
`Chr1:65374875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:65374885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:65374888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:65374905`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A11,B118,B132,B139,B17,B21,B37,B40,B41,B44,B45,B54,B57,B58,B59,B77,B88,B92,C18,C19,C31,C37,C58,C6,C60,C62
`Chr1:65374908`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,A11,B118,B132,B139,B17,B21,B37,B40,B41,B44,B45,B54,B57,B58,B59,B77,B88,B92,B99,C18,C19,C31,C37,C58,C6,C60,C62
`Chr1:65374918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795400.1

112 aa

112

RVT_1

PF00078 RVT_1 22-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795400.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	22	112	5.3e-12	46.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939417.1
ATGAATGAATTCCACGCCAATGGTATGATCCATAGAGGATGCAATTCCTCTTTTATTGTGTTGATTCCAAAGAAGAATGAGAGTGGCTCTTTGGAAGATTACAGACCTATTTATTTGATTAACAGTCTGTACAAGGTGATTGCAAAGACTTTGGCAGGAAGGATGTCTACAGTCCTTAGCACGATTATTTCAGAAAATCAGAGCGCGTTCTTGAGGGGCCGATTTATTCTTGACGGAGTTATCGTACTGAACGAAACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011642
ATGAATGAATTCCACGCCAATGGTATGATCCATAGAGGATGCAATTCCTCTTTTATTGTGTTGATTCCAAAGAAGAATGAGAGTGGCTCTTTGGAAGATTACAGACCTATTTATTTGATTAACAGTCTGTACAAGGTGATTGCAAAGACTTTGGCAGGAAGGATGTCTACAGTCCTTAGCACGATTATTTCAGAAAATCAGAGCGCGTTCTTGAGGGGCCGATTTATTCTTGACGGAGTTATCGTACTGAACGAAACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795400.1
MNEFHANGMIHRGCNSSFIVLIPKKNESGSLEDYRPIYLINSLYKVIAKTLAGRMSTVLSTIISENQSAFLRGRFILDGVIVLNETIEEAKRSGKGRVFFKIDFAKAYDSVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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