当前解析结果
SmilChr01G004728| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004728 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004728 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004728 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 65459020 - 65461362 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005073 |
|---|---|
| GeneID | 131005073 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005073 |
| 原始查询 | SmilChr01G004728 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838160]; symbol=AT1G15900; hit=AT1G15900; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838160]; symbol=AT1G15900; hit=AT1G15900; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G15900 (AT1G15900)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838160] identity=58.5; qcov=0.914; evalue=5.3e-29; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005073 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057787855.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057787855.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057787855.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057787855.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057787855.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:65460884 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B23,B33,B83,C29 |
Chr1:65460892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B83,B84,C59 |
Chr1:65460944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B131,B90,B92 |
Chr1:65461013 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr1:65461055 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr1:65461105 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA8 records
下载 CDS FASTA8 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。