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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004741`

染色体: Chr01 坐标: 65599698-65602668 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004741`
名称	SmilChr01G004741
描述	acetylornithine aminotransferase, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65599698 - 65602668 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005081`
GeneID	`131005081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005081`
原始查询	`SmilChr01G004741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acetylornithine aminotransferase, chloroplastic/mitochondrial
产物	acetylornithine aminotransferase%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G80600` (WIN1) HOPW1-1-interacting 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844399] identity=77.2; qcov=0.87; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0129100` - identity=74.1; qcov=0.637; evalue=9.75e-160; confidence=high
GO	GO:0006525 (arginine metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0042802 (identical protein binding)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00202 (Aminotran_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057787871.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057787871.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057787871.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057787871.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65599977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:65600135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C74,D10,D2
`Chr1:65600650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:65600729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:65602136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B11,B69
`Chr1:65602204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:65602303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B33,C29
`Chr1:65602325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787871.1

460 aa

230

460

Aminotran_3

PF00202 Aminotran_3 75-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787871.1`	Pfam	`PF00202`	Aminotran_3	Domain	75	450	6.1e-117	391.4	Aminotransferase class-III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931888.1
AAAGATAGTTACGTAATCTTGACTAATATTAGATCGCGTACACAAATTGCATTTATTTTGACTATAATCAACAAGTGTCTGTGTCCCACGTGACGTGTAAATCAAATACCCTTTTCACAGTAATTTCTTGAGCCGCCGCGCCGCACCCCTCAACTCCAACCTCCTCCACGGCACCGCTGCCGCCACCACCACCATTTCCTCAAATTAAAACAATCGTCACTTCCTCTCACCTGAAAATGAGCTGGTCGCTACATCTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005081
ATGAGCTGGTCGCTACATCTCCCCCTCAACAACCCTCACTCCGCCGGCCTACACGGCTCTCTAACCCTCAAACCCGCCAATTACTGCTCCGCGCCCGCGGCCTGCCTCAATGTGGACGTGCGTACACCCGATTCCCACCGGACCCCGGCGCTCCACGAGAAGAGGAGCTCGGAAATAATTGCTGACGAGAAGAAATTCATCGTGGGGACGTACGCTAGGGCGCAGGTGGTGCTGGCGAGTGGCAAGGGCTGTAAATTGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787871.1
MSWSLHLPLNNPHSAGLHGSLTLKPANYCSAPAACLNVDVRTPDSHRTPALHEKRSSEIIADEKKFIVGTYARAQVVLASGKGCKLYDVEGREYLDLTSGIAVNALGHGDSDWLRAVTQQAEVLAHVSNVYYSVPQVELAKRLVTGSFADRVFFCNSGTEANEAAIKFSRKFQRYSHPDKNDPPAEFIAFSNCFHGRTMGALALTSKEHYRTPFEPVMPGVTFLEYGDTQAAVELIQSGKIAAVFVEPIQGEGGIYSSTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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