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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004746`

染色体: Chr01 坐标: 65631238-65633447 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004746`
名称	SmilChr01G004746
描述	amino acid transporter AVT6E
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65631238 - 65633447 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005092`
GeneID	`131005092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005092`
原始查询	`SmilChr01G004746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT6E
产物	amino acid transporter AVT6E
Arabidopsis	`AT1G80510` (AT1G80510) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844390] identity=72.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0644700` (OsATL1) - identity=63.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057787881.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057787881.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057787881.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787881.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65632695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:65632898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787881.1

479 aa

240

479

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 65-470 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 66-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787881.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	65	470	1.3e-58	199.4	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057787881.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	66	308	5.8e-06	26.4	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931898.1
TATGCATCTGAAATTGGAATAAATAATTTAATAAGCACCTCACAGAAAAAAAAGGAAGTTGAAAAACAACCAAGTCCAACCTCCAATGGAAACGTTTTGAGCAGAATTCAAGATTCAACAACTCCAAATCCAAAAATCTTATATTTCTGCTATTCTCATTGGTTCTTTTGCCGATTCAGATAAAATTCTTAGCAATTGCAGCTAAGATCTGGGATCCCCTTTTACCAAAATCAGCCCATTCTTGAATTTCAAGAAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005092
ATGGATAGCAATTACTCGAAATTAGATGTGAAAGATGAAAATTTTCTATTGAAGACTCAAGCTTTCAGATTGATTTCACCCGATCATGAAAATGGGTATTCAAATCGACCTAATGCAAATGGTTTGGATGATGAAGATGACATTGATTTTGATGATTTACCGCTTATTTTTGGTGAAAATAAATCTGGGTCTGGGATTTATGGTGCTGTTTTCAATCTCACCACCTCTATCATTGGTGCTGGCATCATGGCCTTGCCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787881.1
MDSNYSKLDVKDENFLLKTQAFRLISPDHENGYSNRPNANGLDDEDDIDFDDLPLIFGENKSGSGIYGAVFNLTTSIIGAGIMALPATMKVLGLFFGVFLIFFMAILSEISVELLVRFAVQCKAATYGEVVEAALGRTARTLSEICIIVNNAGVLVVYLIIIGDVMSGSLHHMGVFDQWWGHGFWDHRKIVILIVLVLFLAPLCTLDKIDSLSTTSAASVALAIVFVVVVFIVALIKLVEGKIEPPRMMPDFGSKKAILD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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