当前解析结果
SmilChr01G004762| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004762 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004762 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004762 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 65797080 - 65798770 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011725 |
|---|---|
| GeneID | 131011725 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011725 |
| 原始查询 | SmilChr01G004762 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G47680 (AT3G47680)DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=26.5; qcov=0.907; evalue=8.62e-11; confidence=low |
| Rice | Os06g0521000- identity=33.1; qcov=0.694; evalue=3e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011725 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795512.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795512.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795512.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795512.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795512.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:65797085 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A10,A22,B102,B105,B138,B20,B53,B66,B68,B69,B8,B86,B9,B97,C37,C42,C47,C79 |
Chr1:65798258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,C50,C60,C71 |
Chr1:65798324 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B30,D2 |
Chr1:65798330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B64 |
Chr1:65798714 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr1:65798735 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr1:65798736 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,B25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。