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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004770`

染色体: Chr01 坐标: 65876097-65880543 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004770`
名称	SmilChr01G004770
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65876097 - 65880543 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005110`
GeneID	`131005110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005110`
原始查询	`SmilChr01G004770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=30.5; qcov=0.732; evalue=7.96e-66; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.4; qcov=0.82; evalue=2.27e-68; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787904.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787904.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787904.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787904.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65877653`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A16,A18,A23,B101,B104,B105,B111,B120,B122,B123,B127,B130,B133,B136,B138,B139,B14,B2,B36,B41,B56,B6,B69,B74,B80,B82,B85,B89,B91,B94,B96,C11,C14,C20,C22,C28,C34,C35,C38,C40,C44,C46,C48,C49,C53,C56,C57,C60,C63,C65,C67,C69,C74,C75,C76,C77,C79,C85,C86,D10,D9
`Chr1:65877675`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A16,A18,A23,B1,B101,B104,B105,B111,B120,B122,B123,B127,B130,B131,B133,B136,B138,B139,B14,B2,B36,B41,B56,B6,B69,B74,B80,B82,B85,B89,B91,B94,B96,C11,C14,C20,C22,C28,C34,C35,C38,C40,C44,C46,C48,C49,C53,C56,C57,C60,C63,C65,C67,C69,C74,C75,C76,C77,C79,C85,C86,D10,D9
`Chr1:65877678`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr1:65877678`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr1:65877680`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A1,A16,A18,A23,B1,B101,B104,B105,B111,B120,B122,B123,B127,B130,B131,B133,B136,B138,B139,B14,B2,B36,B41,B56,B6,B69,B74,B80,B82,B85,B89,B91,B94,B96,C11,C14,C20,C22,C28,C34,C35,C38,C40,C44,C46,C48,C49,C53,C56,C57,C60,C63,C65,C67,C69,C74,C75,C76,C77,C79,C85,C86,D10,D9
`Chr1:65877692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:65877707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr1:65877712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D10
`Chr1:65877723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C47
`Chr1:65877736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B25,D10
`Chr1:65877758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B65,B87,C36,C59
`Chr1:65877760`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787904.1

881 aa

440

881

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 147-322 aa PF13401 AAA_22 164-258 aa PF23559 WHD_DRP 416-497 aa PF23598 LRR_14 551-821 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787904.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	147	322	3.9e-42	144.5	NB-ARC domain
`XP_057787904.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	164	258	1e-06	29.8	AAA domain
`XP_057787904.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	416	497	2e-13	50.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057787904.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	551	821	4.4e-14	52.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931921.1
CATTGACTTAAACAAAGACTAGAGATAATGTCAGTTTTAAACAATGTTTAATTAATTTAACTAATGCAAGTTGTATGTTTAAAATAATGTCACCCATGTGAAAGAAGTACCGTCTCTTTTGAAACAGCTTTCCAAGAAGCCTCCAAGAAACCTCCAAGTTGAAACATTAATTATTCCTCAAAAATTCATTTCCCCAATCCCAGATTGAAACATCAACCTTCTCAAAAATGATTTAGCTCACTGAAAACCCCCCAAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005110
ATGGCTGCTTATTCTGCCGTCGCCGCTTTCCGGCAGACTCTGAAGCAGCTGCTGGATTCCCACCAGTTTCCTACTCATGTGTCGGAGTCTCAAATCGAATTCCTCCATGAAAACGTCAAATCCTTGCAAGAATCTCTCGACAAAATCGCCTTCGTTCCTAAACTGAAAAGGCCAAGTTTGAAGGAGTTGCAAAACAAAATCAGAGAAGCCATCTACGCAGCCCAAGACGAGGTGGAATATTGGAGCAGAGGCCATTCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787904.1
MAAYSAVAAFRQTLKQLLDSHQFPTHVSESQIEFLHENVKSLQESLDKIAFVPKLKRPSLKELQNKIREAIYAAQDEVEYWSRGHSPEKSGGKTMEELADAIKDVEKEAVVLEQEIRDDPKAQNLFSNNGDEPAFNFSGKDKIVGQEEDFKTVTGWLQADDKARLVIPITGLPGIGKTTLARSIYDDKQTRIQFNIRAWVTVSQDVNYQEVFTKILNTMESKNFQAGHYATQGDEHTLLTKLHQELYNLKYLIVVDDVWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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