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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004773`

染色体: Chr01 坐标: 65922954-65924552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004773`
名称	SmilChr01G004773
描述	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65922954 - 65924552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005114`
GeneID	`131005114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005114`
原始查询	`SmilChr01G004773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
产物	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
Arabidopsis	`AT5G50200` (WR3) nitrate transmembrane transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835085] identity=50.7; qcov=1.04; evalue=9.2e-69; confidence=high
Rice	`Os02g0595900` (NAR2.1) - identity=48.9; qcov=0.857; evalue=1.62e-57; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010167 (response to nitrate); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0015706 (nitrate transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF16974 (NAR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057787911.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057787911.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057787911.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057787911.1`
5	Membrane raft	膜筏	0.20000	`XP_057787911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65923929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:65923992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B117,C57
`Chr1:65924323`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B114,B41,B56,B96,C55,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787911.1

203 aa

102

203

NAR2

PF16974 NAR2 25-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787911.1`	Pfam	`PF16974`	NAR2	Domain	25	166	6.6e-65	217.7	High-affinity nitrate transporter accessory, Ig-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931928.1
AGCTCCAGTTCATATCCAACTATACAAGAATGTAATAAGCTAAGTCAGCCACGCACACAAAACACATAGAAAACACAGTCACACGCACATATCTCTTGAATATACCTTTGGGCCACTCTCACAATTAAACAAATCAAAACATCATTATCAGCCATATTTTCTTCAGTAATCTCTTGTTAATCACTACCACTAACTCCTACAACATCAGCTGGATTATTGTGTTGACTTTTTTCGGGTTAAGTCGGATTTGAAGGTGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005114
ATGGCGATTAATGGATTTCTCTTTGCATCGATCTTGATTTCGTGCTTGGCGGCCACTTGCTACGGTATTACCTTCTCTTCTCTCCAGAGAACTCTTGATGTCACTGCTTCACCTCAATCTGGCCAAGTTCTGAAAGCGGGAGAAGACAATATAACCGTGACGTGGTCGGTGAACACGAGCTTCCCCGCGGGGACGGACTCGAGCTACAAGACAGTGAAGGTGAAGCTGTGCTACGCTCCCATCAGCCAGAAGGATCGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787911.1
MAINGFLFASILISCLAATCYGITFSSLQRTLDVTASPQSGQVLKAGEDNITVTWSVNTSFPAGTDSSYKTVKVKLCYAPISQKDRGWRKTVDIMKKDKTCQHLIVSRPYTSSNNTITYTVKRDVPTATYFIRAYVFNAAAEEVGYGQTTDAHKTTNLFSVDAVSGRHVSLDIASVCFSAFSIVSLFGFFFLEKRKSKALAAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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