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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004776`

染色体: Chr01 坐标: 65943959-65944705 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004776`
名称	SmilChr01G004776
描述	uncharacterized SmilChr01G004776
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65943959 - 65944705 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011748`
GeneID	`131011748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011748`
原始查询	`SmilChr01G004776`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G66235` (AT1G66235) no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=26.1; qcov=0.619; evalue=4.11e-11; confidence=low
Rice	`Os06g0521000` - identity=31.1; qcov=0.629; evalue=7e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795562.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795562.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795562.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795562.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65944069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:65944171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B21
`Chr1:65944285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B6
`Chr1:65944356`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B21,B38,B87,C20,C46,C55,C7,D3
`Chr1:65944382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C64
`Chr1:65944384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:65944388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B112,B2,B36,B45,B53,B61,B7,B88,C20,C25,C32,C37
`Chr1:65944407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B51,B75
`Chr1:65944429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C64
`Chr1:65944432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C64
`Chr1:65944441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:65944540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795562.1

210 aa

105

210

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 112-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795562.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	112	207	4.9e-06	28.2	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939579.1
ATGCCGCCGGCCAAACGTAGCAACTATTATCCGCCAGAAACGGTGCTAATTTGTCGTTTGTATTGCGAGCACACCCACGACTCTGTGGTGGGTGTCGACCAAAAAGGGGCGAAGTTTTGGGGCTCCATCTGCACCCAATACAATGCTGAAAAGCCTCGAGGATCTATTTCACGCGACGTCACGCAAATCAAATCTCTCTTTCAACGGGTGGCGAAGGATTCGAAGAGGTTTGAGGCCATGCACAAAAAATGTCACGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011748
ATGCCGCCGGCCAAACGTAGCAACTATTATCCGCCAGAAACGGTGCTAATTTGTCGTTTGTATTGCGAGCACACCCACGACTCTGTGGTGGGTGTCGACCAAAAAGGGGCGAAGTTTTGGGGCTCCATCTGCACCCAATACAATGCTGAAAAGCCTCGAGGATCTATTTCACGCGACGTCACGCAAATCAAATCTCTCTTTCAACGGGTGGCGAAGGATTCGAAGAGGTTTGAGGCCATGCACAAAAAATGTCACGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795562.1
MPPAKRSNYYPPETVLICRLYCEHTHDSVVGVDQKGAKFWGSICTQYNAEKPRGSISRDVTQIKSLFQRVAKDSKRFEAMHKKCHDQWKSGMSDGQIVEQAEAMWLAEYRVPFRYPHAWKILRESKKFASLGEDVHSDVHSDKRSKGSDGLPTTTSSDASISTRPQGQKAAKRDKRKGNKKVEETSEDNQKALGYMANMVAEIKQRNNIR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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