当前解析结果
SmilChr01G004777| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004777 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004777 |
| 描述 | callose synthase 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 65947874 - 65952344 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005116 |
|---|---|
| GeneID | 131005116 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005116 |
| 原始查询 | SmilChr01G004777 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | callose synthase 3-like |
| 产物 | callose synthase 3-like |
| Arabidopsis | AT5G13000 (GSL12)glucan synthase-like 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831140] identity=76.1; qcov=0.811; evalue=6.47e-88; confidence=high |
| Rice | Os02g0832400 (OsGSL7)- identity=73.9; qcov=0.811; evalue=2.04e-86; confidence=high |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane); GO:0046527 (glucosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005116 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057787914.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057787914.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057787914.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057787914.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057787914.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:65948020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr1:65949803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B29,B35,B73,B97 |
Chr1:65949803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B29,B35,B73,B97 |
Chr1:65949842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,B13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。