当前解析结果
SmilChr01G004793| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004793 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004793 |
| 描述 | cytochrome P450 71A8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 66166658 - 66169694 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005129 |
|---|---|
| GeneID | 131005129 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005129 |
| 原始查询 | SmilChr01G004793 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 71A8-like |
| 产物 | cytochrome P450 71A8-like |
| Arabidopsis | AT3G48280 (CYP71A25)cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 25 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823986] identity=50.4; qcov=0.967; evalue=1.27e-167; confidence=high |
| Rice | Os09g0275400- identity=42.6; qcov=0.933; evalue=2.8e-135; confidence=medium |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005129 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057787926.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057787926.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057787926.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057787926.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057787926.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057787926.1PF00067
p450 49-493 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057787926.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 49 | 493 | 5.2e-104 | 349.3 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。