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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004798`

染色体: Chr01 坐标: 66197176-66199139 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004798`
名称	SmilChr01G004798
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66197176 - 66199139 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005133`
GeneID	`131005133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005133`
原始查询	`SmilChr01G004798`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
产物	aldehyde oxidase GLOX-like
Arabidopsis	`AT1G14430` (AT1G14430) glyoxal oxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838005] identity=45.3; qcov=0.952; evalue=2.8e-145; confidence=high
Rice	`Os03g0258900` - identity=42.6; qcov=0.991; evalue=8.42e-136; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07250 (Glyoxal_oxid_N); PF09118 (GO-like_E_set)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057787932.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057787932.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787932.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66197216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:66197218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B62
`Chr1:66197605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:66198099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B87,C36,C59
`Chr1:66198298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B93,C2,C32,C68
`Chr1:66198490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,B99,C31
`Chr1:66198502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B127,B79,B98
`Chr1:66198745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B127,B79,B98
`Chr1:66198772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,B99,C31
`Chr1:66198895`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B140,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787932.1

566 aa

283

566

Glyoxal_oxid_N

GO-like_E_set

PF07250 Glyoxal_oxid_N 50-441 aa PF09118 GO-like_E_set 452-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787932.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	50	441	2.8e-160	533.9	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057787932.1`	Pfam	`PF09118`	GO-like_E_set	Domain	452	562	3.5e-23	82.5	Galactose oxidase-like, Early set domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931949.1
ACAAAAAACACAATTCACCATGGAAAACAAGAACATAAATCCGCTCTACAAAGAAGCACTCGCCATTGCCTATCTGCTGCTACACTATTCAGCCATCGCCGGAGCAGCCACCGCCGCCCCGCCTGGCCAATGGAAGCTTCTGCTGAACAACACCGGCGTAGTGGCGATGCACATGGCCCTAACTCACTACAACACCGTCCTCATGTTCGACCAGACGAGCTCCGGCCCCTCCAACTACCGCCTGCCCCGCCGCTACAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005133
ATGGAAAACAAGAACATAAATCCGCTCTACAAAGAAGCACTCGCCATTGCCTATCTGCTGCTACACTATTCAGCCATCGCCGGAGCAGCCACCGCCGCCCCGCCTGGCCAATGGAAGCTTCTGCTGAACAACACCGGCGTAGTGGCGATGCACATGGCCCTAACTCACTACAACACCGTCCTCATGTTCGACCAGACGAGCTCCGGCCCCTCCAACTACCGCCTGCCCCGCCGCTACAACGGGCGGCGCTGCCAGAGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787932.1
MENKNINPLYKEALAIAYLLLHYSAIAGAATAAPPGQWKLLLNNTGVVAMHMALTHYNTVLMFDQTSSGPSNYRLPRRYNGRRCQRALVDLADPSCYAHSVEYSVSNNKIRPLFIEPDPWASSGSFLSNGTLLEAGGFGTGSKRVRYFRPCKNSLCDWSQGRKHLTSKRWYASSLRLPDHNDRVIVVGGSNVSSYEFVPKASLNEKSFNLPFLKRTYDAEGGNNLYPILHLSPDGHIFIFANTDSILFNYKRNKVVKTFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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