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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004805`

染色体: Chr01 坐标: 66249065-66252509 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004805`
名称	SmilChr01G004805
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66249065 - 66252509 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005140`
GeneID	`131005140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005140`
原始查询	`SmilChr01G004805`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
产物	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
Arabidopsis	`AT3G01680` (SEOR1) sieve element occlusion amino-terminus protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821097] identity=34; qcov=1.01; evalue=9.88e-137; confidence=low
Rice	`Os01g0794400` - identity=28.6; qcov=0.196; evalue=3.17e-07; confidence=weak
GO	GO:0010088 (phloem development)
KEGG	-
Pfam	PF14576 (SEO_N); PF14577 (SEO_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787940.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057787940.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787940.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787940.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66249239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C8
`Chr1:66249489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B45,B49,C50,C62
`Chr1:66249744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:66249921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B131,B33,B55,C85
`Chr1:66250033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C13,C17,C40,C53
`Chr1:66250079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C13,C17,C40,C53
`Chr1:66250133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C83,C86
`Chr1:66250823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C33
`Chr1:66250844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B71,C56
`Chr1:66250845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C53
`Chr1:66250857`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B29,B34,B86,B87,C11,C29,C80
`Chr1:66250864`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A16,A23,A24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787940.1

714 aa

357

714

SEO_N

SEO_C

PF14576 SEO_N 23-307 aa PF14577 SEO_C 467-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787940.1`	Pfam	`PF14576`	SEO_N	Family	23	307	8.5e-99	331.1	Sieve element occlusion N-terminus
`XP_057787940.1`	Pfam	`PF14577`	SEO_C	Family	467	713	4.1e-78	262.7	Sieve element occlusion C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931957.1
AACATCACACAAAATCCTTGGGAGAAAAAAAAACTAGTAAGCAAAAAAAAAAACTTCGAAAGAAAGAAAAAGCAAAAAATATAAAAATAAGCAATGTTGGACGCCACTGTACCAGCTGGAAATCAGCAGCTCCTCCGCCATGACCGCCGTTCGATGTTTTCGGACGACGTTGCGCTGAGGAATCAAATTCAGGCAACACATGCTTACGATGAGCGCTCGATCGACACCGAATCTATTCTTCTCATTGTTAAGGATATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005140
ATGTTGGACGCCACTGTACCAGCTGGAAATCAGCAGCTCCTCCGCCATGACCGCCGTTCGATGTTTTCGGACGACGTTGCGCTGAGGAATCAAATTCAGGCAACACATGCTTACGATGAGCGCTCGATCGACACCGAATCTATTCTTCTCATTGTTAAGGATATCTTCAATCTTGTTTCCCCTGGAATTGATGGAATTATCAATGGCTCGACTAATCACGCCGGAATCCACGACGAAACGACGGCACTGGTGGACTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787940.1
MLDATVPAGNQQLLRHDRRSMFSDDVALRNQIQATHAYDERSIDTESILLIVKDIFNLVSPGIDGIINGSTNHAGIHDETTALVDSDVIHDTLAFLVNKISIELSCKCSGGGDNHASAVEILNVLSSYTWDAKAVVALASFSVNYGQFWLVANHFTTEPLAKSLAVLKLLPEIIDHSDVMKSRFETINSLVKVSLELTRCISEFRRLPSKYISDEAEPMVVAASHVPIAVYWIVRSLIACSSQVTEILGLSQTASSHTET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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