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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004806`

染色体: Chr01 坐标: 66261904-66264810 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004806`
名称	SmilChr01G004806
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66261904 - 66264810 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005141`
GeneID	`131005141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005141`
原始查询	`SmilChr01G004806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
产物	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
Arabidopsis	`AT3G01680` (SEOR1) sieve element occlusion amino-terminus protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821097] identity=34.4; qcov=1.01; evalue=2.31e-141; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0010088 (phloem development)
KEGG	-
Pfam	PF14576 (SEO_N); PF14577 (SEO_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057787941.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057787941.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787941.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787941.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787941.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66262150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:66262280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B95,C14,C74
`Chr1:66262603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B24,B46,B78,C26,C8
`Chr1:66262603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B46,B78,C26,C8
`Chr1:66262653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:66262969`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B112,B13,B15,B64
`Chr1:66262969`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B112,B13,B15,B64
`Chr1:66262999`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	132	A1,A10,A11,A14,A18,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B113,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B136,B138,B139,B14,B15,B18,B19,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B6,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B80,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B96,B98,C14,C15,C18,C2,C23,C25,C29,C34,C35,C41,C43,C48,C49,C51,C52,C53,C56,C57,C59,C61,C64,C67,C70,C71,C74,C75,C76,C78,C79,C83,C86,D1,D10,D4,D9
`Chr1:66263007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A7,B136,B20,B40,B6,B68,B69,B7,C14
`Chr1:66263018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C66
`Chr1:66263172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:66263187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,C1,C5,C51,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787941.1

714 aa

357

714

SEO_N

SEO_C

PF14576 SEO_N 15-311 aa PF14577 SEO_C 477-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787941.1`	Pfam	`PF14576`	SEO_N	Family	15	311	2e-76	257.6	Sieve element occlusion N-terminus
`XP_057787941.1`	Pfam	`PF14577`	SEO_C	Family	477	713	5.6e-80	268.8	Sieve element occlusion C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931958.1
GTAAAACATAAGAGAATTAAGAGAGAGAATGGGAAGCCTTAGTGTATCATCGAAGAAGATGGTTTCTGTTTCGGATGAGACTGCGCTGAGGAAGAAGATTCTAGGAACTCATGCTTACGATGGCGGCATCTTCGACACCGAAGCGATCCTCTCCACCGTCGAAGGAATCCTCGATCTTGTCACGCCGGGGTTTGACGTCGTCATTCCTAATGTCACCACCATTTTTCATGGGGTTGATGCCACTCTCAATGGATCGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005141
ATGGGAAGCCTTAGTGTATCATCGAAGAAGATGGTTTCTGTTTCGGATGAGACTGCGCTGAGGAAGAAGATTCTAGGAACTCATGCTTACGATGGCGGCATCTTCGACACCGAAGCGATCCTCTCCACCGTCGAAGGAATCCTCGATCTTGTCACGCCGGGGTTTGACGTCGTCATTCCTAATGTCACCACCATTTTTCATGGGGTTGATGCCACTCTCAATGGATCGGTGGGTCATGTCGAAAAACGCATTGCCAGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787941.1
MGSLSVSSKKMVSVSDETALRKKILGTHAYDGGIFDTEAILSTVEGILDLVTPGFDVVIPNVTTIFHGVDATLNGSVGHVEKRIARLGGLESVPDTLPYLLHKISCVLTCKCSGGDSHASAMEILKLLSTYTWEAKIVIVLASYVVDYAQFSLITKLYTTNPLARLIAVLKQIPENLDDISLVIKSKFETIIKLVKVSIEVTRLITKFSNLPSKYISNDAEPMVVALTQIPIAVYWITRVIVACAAQITEILGISEVISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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