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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004816`

染色体: Chr01 坐标: 66343230-66345748 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004816`
名称	SmilChr01G004816
描述	cineole synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66343230 - 66345748 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005153`
GeneID	`131005153`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005153`
原始查询	`SmilChr01G004816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cineole synthase 1, chloroplastic-like
产物	cineole synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G24210` (TPS10) terpene synthase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816955] identity=42.8; qcov=0.96; evalue=3.58e-158; confidence=medium
Rice	`Os07g0218200` (TPS3) - identity=32.4; qcov=0.913; evalue=1.53e-75; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005153

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057787953.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787953.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057787953.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787953.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66343342`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A19,B105,B107,B129,B18,B52,B58,B63,B68,B71,B77,B90,B94,C24,C53,C63,C66,D9
`Chr1:66343345`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A19,B105,B107,B129,B18,B52,B58,B63,B68,B71,B77,B85,B90,B94,C24,C53,C63,C66,D9
`Chr1:66343346`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A20,A22,A5,B104,B113,B17,B20,B27,B31,B33,B46,B47,B78,B9,C18,C37,C44,C47,C5,C60,C7,C72,C74
`Chr1:66343640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B71
`Chr1:66344221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A15,B94,C43,C75
`Chr1:66344221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B94,C43,C75
`Chr1:66344294`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B33,C29
`Chr1:66344294`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B33,C29
`Chr1:66344330`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	165	A10,A11,A13,A14,A18,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B16,B17,B18,B2,B20,B22,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B35,B40,B41,B42,B43,B5,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B93,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C14,C15,C17,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr1:66344332`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	165	A10,A11,A13,A14,A18,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B16,B17,B18,B2,B20,B22,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B35,B40,B41,B42,B43,B5,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B93,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C14,C15,C17,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr1:66344334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C59
`Chr1:66344357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787953.1

599 aa

300

599

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 62-245 aa PF03936 Terpene_synth_C 303-540 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 344-540 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787953.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	62	245	1.5e-45	155.9	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057787953.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	303	540	1.2e-85	287.4	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057787953.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	344	540	1.7e-60	204.9	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931970.1
CAAAGGTTGATCTCAAAATGTTTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTAGCATCCCCGCTTATAATCATCTCCATAAATTACACAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCAAATCCAACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGACAGGCATGTGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005153
ATGTTTATCTCTATATTGCAAATGGCGATTCCTAGCATCCCCGCTTATAATCATCTCCATAAATTACACAGCAGCAAGTCTTCAAAACTTTCTAGTAGCTGCCTCCGCCTGCGTTGCTCCTCCCAACTAAATGCTGATCAACTCCAAATCCAACGACGATCTGGAAACTACAGTCCTTCCCGTTGGGATGTCGACTATATTCAATCACTCCAAAGTGATTATAAGGAAGACAGGCATGTGAGAAGGGCTAGTGAGCTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787953.1
MFISILQMAIPSIPAYNHLHKLHSSKSSKLSSSCLRLRCSSQLNADQLQIQRRSGNYSPSRWDVDYIQSLQSDYKEDRHVRRASELIMQVKKMLEKETDPTRQLELIDELQRLGLSEHFHNEFKEILNSGHLENKYYKNGEIITQEAGKKNLYSTALAFRLLRQHGFQVAQEVFECFKNEEGEFKASLRDDTRGLLQLYEASFMLTEGENTLDIAREFATKILQEKLVNDEIDDNNLITWIRHSLEIPIHWSVERVNTSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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