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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004817`

染色体: Chr01 坐标: 66345812-66348746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004817`
名称	SmilChr01G004817
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66345812 - 66348746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005152`
GeneID	`131005152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005152`
原始查询	`SmilChr01G004817`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=24.6; qcov=0.751; evalue=1.17e-27; confidence=weak
Rice	`Os02g0272900` - identity=27.2; qcov=0.53; evalue=3.84e-22; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057787952.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787952.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787952.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787952.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66346015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C53,C87
`Chr1:66346015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C87
`Chr1:66346143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:66346149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C19
`Chr1:66346152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:66346184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B12,B55
`Chr1:66346184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr1:66346282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B122,B87,C36,C59
`Chr1:66346282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B87,C36,C59
`Chr1:66346291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D4
`Chr1:66346319`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,A14,A24,B139,B19,B32,C4,D1
`Chr1:66346389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787952.1

775 aa

388

775

LRR_14

PF23598 LRR_14 447-722 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787952.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	447	722	1.7e-17	64.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931969.1
GAAATACAGTAAAACAATAGGTTAAATTGTTGTTGTCCTTTTCTTTTTCTCCTTAAGGGGGGTTCAAACCGCCGGCTTCACCAACCTTCCCAACTCAGTCCCACCACCATCGACAAATCAACTTACAATAAATCTTTGAATTCGTCTCGACATCTGTAGCCTCATGGCTTTTGTTGCTGTGATTTCTCTCAAGGACACAATACGCCGCCTTCTAAATTCTCCTCATATCTCAGTCGCCTCTTCAACTCGAGAAATCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005152
ATGGCTTTTGTTGCTGTGATTTCTCTCAAGGACACAATACGCCGCCTTCTAAATTCTCCTCATATCTCAGTCGCCTCTTCAACTCGAGAAATCCTTGAATTTGCACATGAGCGCGTCGAATCGCTACAGGAAGCACTCAGAACATACGACGACATCAGAAACAGCAGCAGAGGAGTGATGGCTTCCGATGCACGAATCAGAGAGGAAGCACGCAGTTTAGAAGATGCCATTGAATCCGATGCTTCAGCTCAGTTTCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787952.1
MAFVAVISLKDTIRRLLNSPHISVASSTREILEFAHERVESLQEALRTYDDIRNSSRGVMASDARIREEARSLEDAIESDASAQFLSQSQIHGALSLNLHHLTQHIHRFAETANYLEHEYIMELNKPSDKEENVAAAAGVTTLTDSGGNECEMVGLSDQFLQIRKLLIEDVNYQEFNSTFEIDVANFGQILYTIGIDGMPGIENNGSRIMVTARISADFHCIDFHKMRFMDQEESWDLLRKTVFDEQGCPPQLVKAGKKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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