当前解析结果
SmilChr01G004822| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004822 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004822 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004822 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 66396804 - 66400129 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005158 |
|---|---|
| GeneID | 131005158 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005158 |
| 原始查询 | SmilChr01G004822 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | vacuole protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829503]; symbol=AT4G33625; hit=AT4G33625; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | vacuole protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829503]; symbol=AT4G33625; hit=AT4G33625; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G33625 (AT4G33625)vacuole protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829503] identity=64.6; qcov=0.921; evalue=1.4e-85; confidence=high |
| Rice | Os07g0118300- identity=66; qcov=0.774; evalue=1.01e-68; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005158 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.80000 | XP_057787956.1 |
| 2 | Endosome | 内体 | 0.80000 | XP_057787956.1 |
| 3 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.80000 | XP_057787956.1 |
| 4 | Secretory vesicle | Secretory vesicle | 0.40000 | XP_057787956.1 |
| 5 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057787956.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:66397711 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B127,B79,B98 |
Chr1:66399437 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B83,C59,D11 |
Chr1:66399780 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。