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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004825`

染色体: Chr01 坐标: 66419646-66425315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004825`
名称	SmilChr01G004825
描述	KH domain-containing protein HEN4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66419646 - 66425315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005160`
GeneID	`131005160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005160`
原始查询	`SmilChr01G004825`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein HEN4-like
产物	KH domain-containing protein HEN4-like
Arabidopsis	`AT1G51580` (AT1G51580) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841583] identity=32.5; qcov=0.981; evalue=3.74e-90; confidence=low
Rice	`Os09g0498600` - identity=34; qcov=0.86; evalue=6.24e-87; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787960.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787960.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787960.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787960.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66420148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:66420281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B50
`Chr1:66420304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,C20,C23,C58,C6
`Chr1:66420404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:66420616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B50,D11
`Chr1:66422151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:66422172`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr1:66422172`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr1:66422512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B33,C85
`Chr1:66422566`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr1:66422566`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr1:66423370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,C11,C37,C40,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787960.1

645 aa

322

645

KH_1

PF00013 KH_1 33-88 aa PF00013 KH_1 152-218 aa PF00013 KH_1 296-345 aa PF00013 KH_1 387-453 aa PF00013 KH_1 575-638 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787960.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	33	88	1.7e-65	217.4	KH domain
`XP_057787960.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	152	218	1.7e-65	217.4	KH domain
`XP_057787960.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	296	345	1.7e-65	217.4	KH domain
`XP_057787960.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	387	453	1.7e-65	217.4	KH domain
`XP_057787960.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	575	638	1.7e-65	217.4	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931977.1
TTTTCGTTCTCGAGTGGATGGGATCCTCCACGGTGACGGTGCACAGAAGAAGGAGGAAATTTTGACATTTTTGATTTTATCTTTTTGTTATTTTGGTGTGCAGGGCAGGGGCAGGGTGCAGTTCATAGTAGGGATCTTTTTCCGTGAGACCATGGAAAATAAATAATCATTCATCATTCATAATTAAGCTACAAAATATAGTAAGTAAAAGTTACTAAAACAAAAGGCCTTTTCCACTCCTTCTGCAACTCAAATCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005160
ATGCACGAACCCAATTCCAACAACAACGGCGCCCCCAAACGCCCTAATAAGCCTCCACAGCCGCCCCTCTTCATCCCGCCCGGCCACGTCGCCTTCCGCCTCCTCTGCCACGCCTCCCGCATCGGCGGCCTCATCGGGAAATCCGGCTCCATCATCAAGCAACTCCAGCAGCTCACAAACTCCAGAATCCGGGTCGAGGACCCGCCCCAGTCCAGCGACAATCGGGTCATCAGCGTCGTTGCGTCGCCGGCTACCGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787960.1
MHEPNSNNNGAPKRPNKPPQPPLFIPPGHVAFRLLCHASRIGGLIGKSGSIIKQLQQLTNSRIRVEDPPQSSDNRVISVVASPATVKRIKLCAAALNYGEENNGDAEIGADGEDLWFDVSAAQEGIVRVFERVVQVAAEGDAVAGIGGVVSCRLLVSKFQGGAVIGKGGKVVEKIRKDTGCKIKVLAVEKNFSSSSSMDEIVEIEGLGLAVKKALVAVTSRLQEFPPPEETRPYPARPLESEPLPLQTVDLPLQRSPILQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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