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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004829`

染色体: Chr01 坐标: 66434750-66435869 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004829`
名称	SmilChr01G004829
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66434750 - 66435869 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005167`
GeneID	`131005167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005167`
原始查询	`SmilChr01G004829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
产物	sabinene synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G25820` (TPS-CIN) terpene synthase-like sequence-1,8-cineole [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822175] identity=45.5; qcov=0.62; evalue=1.58e-33; confidence=medium
Rice	`Os01g0920400` (OsDRP3A) - identity=48.4; qcov=0.389; evalue=2.09e-19; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0010333 (terpene synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02212 (GED); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057787967.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057787967.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057787967.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787967.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66434913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C42,C55,C84
`Chr1:66434915`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B39,B7,C14,C45,D5
`Chr1:66434915`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B39,B7,C14,C45,D5
`Chr1:66435117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:66435268`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C39
`Chr1:66435268`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C39
`Chr1:66435339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:66435853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787967.1

234 aa

117

234

GED

Terpene_syn_C_2

Terpene_synth_C

PF02212 GED 74-117 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 82-230 aa PF03936 Terpene_synth_C 92-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787967.1`	Pfam	`PF02212`	GED	Family	74	117	2e-06	28.6	Dynamin GTPase effector domain
`XP_057787967.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	82	230	7.1e-33	114.8	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding
`XP_057787967.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	92	230	6.3e-36	124.6	Terpene synthase family, metal binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931984.1
ATGACAATCATTAAATGCGTCTTATTAGTAAGCAATGCTGGTTCGAGTTGGGGAATATCTTCAATATTTGGCGGAAATGACAATCATACATCACCTAAAGAGAACTCGACCAGCAATCCATTTAATGAACCTGTTCAAAGCATGGAACAGAGAATGTCGATGATCCATTTGAGAGAGCCCCCTAGTGTGTTGAGGTCGTCAGAACCTGACTCAGACGAAAAGACCATTGAGATTACTGCTACAAAGTTGTTACTGAGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005167
ATGACAATCATTAAATGCGTCTTATTAGTAAGCAATGCTGGTTCGAGTTGGGGAATATCTTCAATATTTGGCGGAAATGACAATCATACATCACCTAAAGAGAACTCGACCAGCAATCCATTTAATGAACCTGTTCAAAGCATGGAACAGAGAATGTCGATGATCCATTTGAGAGAGCCCCCTAGTGTGTTGAGGTCGTCAGAACCTGACTCAGACGAAAAGACCATTGAGATTACTGCTACAAAGTTGTTACTGAGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787967.1
MTIIKCVLLVSNAGSSWGISSIFGGNDNHTSPKENSTSNPFNEPVQSMEQRMSMIHLREPPSVLRSSEPDSDEKTIEITATKLLLRSYYDIVRKSIQDYVPKAMHFLWIDLSGACFQEAKWYHNGYTPSLEEYLSNAKTSIAAPSIISQLYFTFPNSTDKMAIHLLYQYHHILYLSGMILRLADDLGTAQHELKRGDVLKAVQCYMKERNASEKEAQEHVRFLIREAWKEMNTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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