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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004833`

染色体: Chr01 坐标: 66461831-66464241 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004833`
名称	SmilChr01G004833
描述	uncharacterized SmilChr01G004833
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66461831 - 66464241 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005170`
GeneID	`131005170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005170`
原始查询	`SmilChr01G004833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cox19-like CHCH family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830816]; symbol=AT5G09570; hit=AT5G09570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Cox19-like CHCH family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830816]; symbol=AT5G09570; hit=AT5G09570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G09570` (AT5G09570) Cox19-like CHCH family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830816] identity=58.2; qcov=1.01; evalue=1.53e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0685500` - identity=69.3; qcov=0.945; evalue=5.72e-43; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0007005 (mitochondrion organization)
KEGG	-
Pfam	PF06747 (CHCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057787971.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057787971.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787971.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787971.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66462998`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	134	A15,A16,A18,A22,A23,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B107,B110,B111,B114,B117,B118,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B20,B23,B24,B29,B33,B34,B36,B39,B42,B44,B47,B5,B55,B57,B6,B61,B62,B64,B66,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B8,B82,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C1,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C25,C27,C28,C30,C33,C38,C39,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C62,C63,C65,C66,C67,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D8,D9
`Chr1:66462999`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	133	A15,A16,A18,A22,A23,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B107,B110,B111,B114,B117,B118,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B20,B23,B24,B29,B33,B34,B36,B39,B42,B47,B5,B55,B57,B6,B61,B62,B64,B66,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B8,B82,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C1,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C25,C27,C28,C30,C33,C38,C39,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C62,C63,C65,C66,C67,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D8,D9
`Chr1:66463014`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B29,B31,B59,B62,B99,C10
`Chr1:66463022`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B14,B34,B38,B76,C1,C13,C33,C67,C80,C83,D3
`Chr1:66463029`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B48,B51
`Chr1:66463029`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B48,B51
`Chr1:66463267`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B15,C31,C86
`Chr1:66463267`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B15,C31,C86
`Chr1:66463271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:66463272`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B15,C31,C86
`Chr1:66463272`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B15,C31,C86
`Chr1:66463273`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787971.1

146 aa

146

CHCH

PF06747 CHCH 105-139 aa

XP_057787972.1

145 aa

145

CHCH

PF06747 CHCH 104-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787971.1`	Pfam	`PF06747`	CHCH	Domain	105	139	3.4e-09	37.3	CHCH domain
`XP_057787972.1`	Pfam	`PF06747`	CHCH	Domain	104	138	3.4e-09	37.3	CHCH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931989.1
TATAGATGACCTCTCCCTCAAGAAAACAGAACCATCTAGAGACCACATGATCCCATCTCGAATTCCGCATCACCGCATCCCCATCGTAACCCTCTCGACCTCTCATAGCCGATTGGTCCTCATTTTCTTTCAACCAATGATATTTCGGCACGTTCCGGGTTCAGGAAAACTCGGATACAGACGATCTCTCCGACTCCGTCTCCCGTATATATAGCGGTGGGGGTTCTGTTGTTAGCTCCAAGACACCACAATTTCTAATT...

XM_057931988.1
TCATTTTCTTTCAACCAATGATATTTCGGCACGTTCCGGGTTCAGGAAAACTCGGATACAGACGATCTCTCCGACTCCGTCTCCCGTATATATAGCGGTGGGGGTTCTGTTGTTAGCTCCAAGACACCACAATTTCTAATTCTTCGTCGACTTCAACAAAACATAAGTAAAATGCCTCGCCGTAGCTCCGGTGGAAGATCTGCCCGCCCAGCTCCTCGTGCAGCTACACCACGTAACCCACCTCAGCCAGCAGTTCGTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005170
ATGCCTCGCCGTAGCTCCGGTGGAAGATCTGCCCGCCCAGCTCCTCGTGCAGCTACACCACGTAACCCACCTCAGCCAGCAGTTCGTCAAGCTCCTCCTCCAGCTCCTGTTCACAGTAGTTCTGGTGGATCTATGCTTGGTGGAGGCATTGGTTCAACCATAGCTCAAGGTGCGGCTTTTGGTACTGGAAGTGCTGTGGCACACAGGGCAGTAGATGCTGTTATGGGTCCACGGACAATTCAACATGAGGCAGTCGTCTC...

LOC131005170
ATGCCTCGCCGTAGCTCCGGTGGAAGATCTGCCCGCCCAGCTCCTCGTGCAGCTACACCACGTAACCCACCTCAGCCAGTTCGTCAAGCTCCTCCTCCAGCTCCTGTTCACAGTAGTTCTGGTGGATCTATGCTTGGTGGAGGCATTGGTTCAACCATAGCTCAAGGTGCGGCTTTTGGTACTGGAAGTGCTGTGGCACACAGGGCAGTAGATGCTGTTATGGGTCCACGGACAATTCAACATGAGGCAGTCGTCTCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787971.1
MPRRSSGGRSARPAPRAATPRNPPQPAVRQAPPPAPVHSSSGGSMLGGGIGSTIAQGAAFGTGSAVAHRAVDAVMGPRTIQHEAVVSEAIAPTPTASNTGGSDACNVQTKAFQDCLNSSGSDISKCQFYMDMLADCRRNSGSMMSS

XP_057787972.1
MPRRSSGGRSARPAPRAATPRNPPQPVRQAPPPAPVHSSSGGSMLGGGIGSTIAQGAAFGTGSAVAHRAVDAVMGPRTIQHEAVVSEAIAPTPTASNTGGSDACNVQTKAFQDCLNSSGSDISKCQFYMDMLADCRRNSGSMMSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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