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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004845`

染色体: Chr01 坐标: 66589666-66595825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004845`
名称	SmilChr01G004845
描述	oligopeptide transporter 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66589666 - 66595825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005181`
GeneID	`131005181`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005181`
原始查询	`SmilChr01G004845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligopeptide transporter 4
产物	oligopeptide transporter 4
Arabidopsis	`AT5G64410` (OPT4) oligopeptide transporter 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836562] identity=81.8; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0630200` - identity=70.2; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005181

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057787998.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057787998.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057787998.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057787998.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66591229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:66591769`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:66591769`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:66592478`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr1:66592478`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr1:66592504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,C11,C37,C40,C69
`Chr1:66592541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B7,C33,C48
`Chr1:66595112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:66595179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B99,C31
`Chr1:66595244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr1:66595607`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	A13,A14,A18,A20,A24,A8,A9,B105,B106,B113,B119,B127,B137,B140,B23,B25,B44,B58,B73,B79,B88,B9,B94,B95,B98,C1,C16,C20,C25,C27,C36,C44,C49,C50,C57,C64,C66,C75,C76,C79,D1,D7
`Chr1:66595656`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,A22,B53,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787998.1

788 aa

394

788

OPT

PF03169 OPT 91-751 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787998.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	91	751	2.8e-180	601.8	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932015.1
AATGAATATGTGACGCTCCCATTTTTTCCTCCCCACCCCACCACCTCCTACATTTTCTTTATCACCAATTTGCATTATACTATTTCACAAAACATGTTTTCAACTATAATCAATCGAGCATCACACGTCAAATCTTTATTTATTCAATATAAACTTAGGCGAAAACAAATAAATATGAAAACTGCCAACTCTCAGCATATCAATATATATATATATATCACCATAAGAGCAAGTGAAGCTCAACTCAAGATGGGAAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005181
ATGTTTTCAACTATAATCAATCGAGCATCACACGTCAAATCTTTATTTATTCAATATAAACTTAGGCGAAAACAAATAAATATGAAAACTGCCAACTCTCAGCATATCAATATATATATATATATCACCATAAGAGCAAGTGAAGCTCAACTCAAGATGGGAAGTTTGGAAAGGGAGGGTCCAGCATATGGCAACTCGAAAGAAGAAGAGGAGTCCCCCATTGAAGAGGTGCGGCTGACGGTGACCAACACGGATGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787998.1
MFSTIINRASHVKSLFIQYKLRRKQINMKTANSQHINIYIYITIRASEAQLKMGSLEREGPAYGNSKEEEESPIEEVRLTVTNTDDPSLPVWTFRMWFLGVVSCAMLSFLNQFFAYRTEPLVITQITVQVASLPIGHFLASVLPKATFRLPGFGSNRFSLNPGPFNIKEHVLISIFANAGCAFGSGSAYAVGIVTIVKAFYGRNISFLAGWLLIITTQVLGYGWAGLLRKYVIEPAHMWWPGTLVQVSLFRALHEKDEER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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