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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004848`

染色体: Chr01 坐标: 66628836-66635960 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004848`
名称	SmilChr01G004848
描述	rDNA transcriptional regulator POL5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66628836 - 66635960 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005184`
GeneID	`131005184`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005184`
原始查询	`SmilChr01G004848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rDNA transcriptional regulator POL5-like
产物	rDNA transcriptional regulator POL5-like
Arabidopsis	`AT5G64420` (AT5G64420) DNA polymerase V family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836563] identity=57.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0135700` - identity=47.4; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008134 (transcription factor binding)
KEGG	-
Pfam	PF04931 (DNA_pol_phi)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005184

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788001.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057788001.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788001.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788001.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66629202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:66629336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B66
`Chr1:66629354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C11,C40,C69
`Chr1:66629374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:66629423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:66630776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B25,C79
`Chr1:66631689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B25,C79
`Chr1:66631850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D3
`Chr1:66632385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A11,A18,A20,B109,B11,B126,B31,B45,B6,B93,C10,C18,C54,C72
`Chr1:66632730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:66633308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B66
`Chr1:66633312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C11,C40,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788001.1

1292 aa

646

1292

DNA_pol_phi

PF04931 DNA_pol_phi 199-1007 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788001.1`	Pfam	`PF04931`	DNA_pol_phi	Family	199	1007	2e-164	549.5	DNA polymerase phi

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932018.1
AAGATTGACGTAACATGTAGCCCATTTTGACATGTACTCTCTAGGTTACAAATCCCTACAAAACAAACCGCAATTCACACCAGAAATCCTCCCCCTTCCGCTCTCTCTCCCTTCTCTCCGCCGTCCGGCGAGAAATCTCCGTCACGCCGCTGCTCCACACATTCCACCGCCGCCGCCTTCAGAAAAATTAAGTTTTGAGCTGAGGTAAATGGGTAGCAAGAAGAGAGAGTCGAGTTCGGCGCTGGAATCCGCGGTAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005184
ATGGGTAGCAAGAAGAGAGAGTCGAGTTCGGCGCTGGAATCCGCGGTAGAGAATGGCGAAGATAAGCAGAAATTGAACGTGAGCTCTGAGAATGCGGATGTAGAACCCTCGAGAAAGAGAATGAAAAAGGAGAAAAAGAAGAAGGATATTGAGTTACCGGAGACTGAGAGTGTGAATGATGCTGATGCTGATGCTGCACCGGCATCTTCGAGTGCTCACAAGGCTTCCTTGAATTCGATGGAGAGGAAAAAACATAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788001.1
MGSKKRESSSALESAVENGEDKQKLNVSSENADVEPSRKRMKKEKKKKDIELPETESVNDADADAAPASSSAHKASLNSMERKKHRKLQDKVRHGADGQKIDSGPEKMNVELKIDGNESGGTSSSGGGVLPKFHIGVFKELGAADASVRKAAAKTLVVELREVQNAYDKLENKDEVEDKSNLEAEKDDGLNNCAPSVRYAVRRLIRGVSSSRECARQGFALGLTMLVGMVHSIKLESLLKLITTLLEVSSSMKGQEVKDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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