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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004849`

染色体: Chr01 坐标: 66636330-66639821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004849`
名称	SmilChr01G004849
描述	transcription factor GTE7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66636330 - 66639821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005186`
GeneID	`131005186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005186`
原始查询	`SmilChr01G004849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor GTE7-like
产物	transcription factor GTE7-like
Arabidopsis	`AT1G73150` (GTE3) global transcription factor group E3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843646] identity=35.1; qcov=0.63; evalue=2.92e-60; confidence=medium
Rice	`Os04g0623100` - identity=43.2; qcov=0.267; evalue=1.79e-29; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain); PF17035 (BET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788003.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788003.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788003.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788003.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66637190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:66637292`	`ACC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A22,B35,C80
`Chr1:66637297`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A5,A9,B86,B9,C44,C45
`Chr1:66637298`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A5,A9,B86,B9,C44,C45
`Chr1:66637738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B64,B78
`Chr1:66637928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr1:66638163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:66638182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B41,C11,C40,C69
`Chr1:66638217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:66638371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C25
`Chr1:66638605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:66638636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788003.1

633 aa

316

633

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 184-269 aa PF17035 BET 420-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788003.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	184	269	6.1e-19	68.5	Bromodomain
`XP_057788003.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	420	481	1.5e-21	76.9	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095214.1
GAATAAAATGAAGCACGACGCAGAAGACAAGAGTTGTAAGAAGAGGCAGTTGTATTAATTGCAAGGGCAGTATGGTAAATTGAAAGAAAGTCGGCTTTGATCTGGTTGTGGTGAGATCCTCCTGATACGTCACGTGCCAAAGCGAGTTTTCTTCACATTCACGTCGTTAATTTCCACGTCACCCGTTTGAGGGGGAGCCCACACAAACCCTAAAAATTGCCACATACCACCAATTTCACCTCATACCCAAACGCCTTGAC...

XM_057932020.1
ACACGGCTATGATGCTGCCCGAAATATAAGCGGGCAGATCTCATTGCCTTTAAGAGGCACGCCCTCTCCTTCTCATTTCTTCGCTCAAACCCTAAATATCTCTACACCGTCGTAAAATTGGTGTCTAGTTTAATTCGTTGTTTCTTTTCCCCCAAAATTTTAGCCAAATTTTTAATCTAATATAGCCCCGTGCTGCCGCAGATCGTTCGGCGAAGGGGTTTTCGCGGCGGAGAGGAGATTCTGGCTGTTCGATACATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005186
ATGGCGTCCGCCGTTCTAGCGAGTCAGAATGAGTCGAGCTGGGCCCACATGGGAAAGACGCAGTACGTGAATCCCCACCTCAATTCAAACCCTCATCCTAACCCTAAGAAGAAGCAGAAGCAATTCCACCCATCTGCGGCCAACGGTGTCGCCGGTCGTTACCGCAGCAGCAACAACAACTTCGATTCACCGGCCGTCACACAGACGGCGTCCGATGATGCCTATTCTTTCAACCAGACGCCCGCCCCGCGTAACGTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788003.1
MASAVLASQNESSWAHMGKTQYVNPHLNSNPHPNPKKKQKQFHPSAANGVAGRYRSSNNNFDSPAVTQTASDDAYSFNQTPAPRNVGNYGGLLTFNVAMYTKSELLDLRKRLFAELDQIRDLRDRIESGRFNIGETPRSQPKSKKFSGSKRPGPAIGSAPKKLNDGYDNGSLEAVNFGDLLKECEKIVGKLIKHKKFGYVFRAPVDAVAFGLLDYHQIVKHPMDLGTVKANLAKNVYRTPVDFAADVRLTFNNALLYNPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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