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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004859`

染色体: Chr01 坐标: 66747703-66749896 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004859`
名称	SmilChr01G004859
描述	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66747703 - 66749896 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005197`
GeneID	`131005197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005197`
原始查询	`SmilChr01G004859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
产物	peptide methionine sulfoxide reductase B5-like
Arabidopsis	`AT4G21860` (MSRB2) methionine sulfoxide reductase B 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828274] identity=78.1; qcov=0.702; evalue=6.48e-82; confidence=high
Rice	`Os05g0404200` (OsMSRB3) - identity=76.6; qcov=0.76; evalue=4.22e-85; confidence=high
GO	GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0030091 (protein repair); GO:0033743 (peptide-methionine (R)-S-oxide reductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01641 (SelR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788013.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057788013.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788013.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788013.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66747946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C15,C21
`Chr1:66749530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C11,C40,C69
`Chr1:66749624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788013.1

208 aa

104

208

SelR

PF01641 SelR 88-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788013.1`	Pfam	`PF01641`	SelR	Domain	88	201	5.1e-43	146.5	SelR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932030.1
TTATTCCATTTTATCCTATTATCCCAAAGAGCCAAGAAGCACGTGGCCAAATCCCCCTTACATTTCGTAGCTTGCTCCTCAGCCACGGACTATCTCCATGGACATGGAGTAATGCAAGAAACAAGAAAAGAAACGAGGCGATTAATTTAATTAAATGATCAAAATGGGCTCGCAAATAATGAAAGTCACGCCTTTCGCAGCTTCTAGAACGTTCATTGCCAGCGGCCCCGCTCTCGCAACACTCAATCGCATCCCTAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005197
ATGATCAAAATGGGCTCGCAAATAATGAAAGTCACGCCTTTCGCAGCTTCTAGAACGTTCATTGCCAGCGGCCCCGCTCTCGCAACACTCAATCGCATCCCTAAAGCTCCCATTTCTCAAATAATTAGACATAGCAGCTACTTGTCGGGTGGGGTTTCTGGGTTGGGTCTAAATCGGGGGAAGAAGGGTTTCAGAAGCGGAGTTGTGGCCATGGCTACTACTAATTCAGTGCATAAATCGGATGAGGAGTGGCGCGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788013.1
MIKMGSQIMKVTPFAASRTFIASGPALATLNRIPKAPISQIIRHSSYLSGGVSGLGLNRGKKGFRSGVVAMATTNSVHKSDEEWRAVLSPEQFRILRLKGTEFPGTGEYDKFFGEGIYECAGCGTPLYKSSTKFNSGCGWPAFYEGLPGAINRTGDPDGRRIEITCAACGGHLGHVFKGEGFRTPTDERHCVNSVSLKFTPGNSESSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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