当前解析结果
SmilChr01G004871| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004871 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004871 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004871 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 66828607 - 66831026 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005209 |
|---|---|
| GeneID | 131005209 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005209 |
| 原始查询 | SmilChr01G004871 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005209 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057788030.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057788029.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057788029.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057788029.1 |
| 5 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.20000 | XP_057788030.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:66829708 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | B22,B26,B30,B32,B49,B54,B58,B68,B74,B75,B83,B89,C19,C41,C42,C5,C51,C64,C66,C9,D9 |
Chr1:66829719 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A10,A23,A24,B1,B101,B110,B123,B126,B135,B138,B26,B46,B69,B7,B70,B87,B93,C13,C17,C32,C39,C40,C45,C58,C60,C68,C70,C78,D2,D5 |
Chr1:66829724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B16 |
Chr1:66829738 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,A22,B53,C37,C84 |
Chr1:66829778 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,D8 |
Chr1:66829797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B136,B16 |
Chr1:66829797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B16 |
Chr1:66829799 |
ACG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 22 | B22,B26,B30,B32,B45,B49,B54,B58,B68,B74,B75,B83,B89,C19,C41,C42,C5,C51,C64,C66,C9,D9 |
Chr1:66830045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr1:66830069 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 41 | A10,A19,A2,A3,A4,B10,B102,B108,B117,B121,B124,B129,B131,B132,B135,B136,B137,B140,B42,B43,B46,B48,B52,B53,B76,B8,B88,B94,C17,C2,C23,C42,C50,C55,C6,C60,C61,C71,C80,D10,D2 |
Chr1:66830104 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,D8 |
Chr1:66830106 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 40 | A10,A19,A2,A3,A4,B10,B102,B108,B117,B121,B124,B129,B131,B132,B135,B136,B137,B140,B42,B43,B46,B48,B52,B53,B76,B8,B94,C17,C2,C23,C42,C50,C55,C6,C60,C61,C71,C80,D10,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
19 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。