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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004872`

染色体: Chr01 坐标: 66831346-66832990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004872`
名称	SmilChr01G004872
描述	transcription factor bHLH19-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66831346 - 66832990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005211`
GeneID	`131005211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005211`
原始查询	`SmilChr01G004872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH19-like
产物	transcription factor bHLH19-like
Arabidopsis	`AT2G22760` (AT2G22760) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816806] identity=42; qcov=0.815; evalue=1.5e-31; confidence=medium
Rice	`Os03g0725800` (OsbHLH018) - identity=37.7; qcov=0.81; evalue=2.1e-30; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788032.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788032.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788032.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788032.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66831724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:66831962`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr1:66831962`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr1:66832056`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A21,B64
`Chr1:66832056`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A21,B64
`Chr1:66832407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A22,B53,C37,C84
`Chr1:66832529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A16,B102,B6,B80,C20,C21,C44,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788032.1

218 aa

109

218

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 56-101 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 146-214 aa

XP_057788033.1

216 aa

108

216

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 54-99 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 144-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788032.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	56	101	1.7e-12	47.6	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057788032.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	146	214	7.6e-05	23.5	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain
`XP_057788033.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	54	99	1.8e-12	47.6	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057788033.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	144	212	7.4e-05	23.5	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932050.1
GTTTGTTGGCCTTATAAATCCATGCTAATCAAGAAACTTGGAACTTAATTCCGTGACACAAAAACGTATATACTGCTAGCGTTGTTCTTCATTCTCAGATACATACATGCATGGTTCGGTTATTAATTAGCTAGATGCAGGTAATTTCATATATCTATTAATTCTTGGTTAATGGAGATCTCAGCAGGCTTCAATAGCTCAGCTGATTTGCAATATTGGAGTTGGGGAGTAGATGGGGATTGTGATCAGGAGGAGAGTAG...

XM_057932049.1
GTTTGTTGGCCTTATAAATCCATGCTAATCAAGAAACTTGGAACTTAATTCCGTGACACAAAAACGTATATACTGCTAGCGTTGTTCTTCATTCTCAGATACATACATGCATGGTTCGGTTATTAATTAGCTAGATGCAGGTAATTTCATATATCTATTAATTCTTGGTTAATGGAGATCTCAGCAGGCTTCAATAGCTCAGCTGATTTGCTGCAGCAATATTGGAGTTGGGGAGTAGATGGGGATTGTGATCAGGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005211
ATGGAGATCTCAGCAGGCTTCAATAGCTCAGCTGATTTGCAATATTGGAGTTGGGGAGTAGATGGGGATTGTGATCAGGAGGAGAGTAGGCCTTTGAAGCAGCTCAGAGCTTCCCCATTTGGGAACACAAATTGTACACTACTCAATTCATCAATAGACCGTAATTTAGCTGAGAGAAATAGGAGAGAGAAGTTAACCCGCAGATTTGCAGCACTGTCTACTCTACTCCCTGCATTGAAAAAGAGGAACAAGGCTTCCAT...

LOC131005211
ATGGAGATCTCAGCAGGCTTCAATAGCTCAGCTGATTTGCTGCAGCAATATTGGAGTTGGGGAGTAGATGGGGATTGTGATCAGGAGGAGAGTAGGCCTTTGAAGCAGCTCAGAGCTTCCCCATTTGGGAACACAAATTGTACACTACTCAATTCATCAATAGACCGTAATTTAGCTGAGAGAAATAGGAGAGAGAAGTTAACCCGCAGATTTGCAGCACTGTCTACTCTACTCCCTGCATTGAAAAAGAGGAACAAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788032.1
MEISAGFNSSADLLQQYWSWGVDGDCDQEESRPLKQLRASPFGNTNCTLLNSSIDRNLAERNRREKLTRRFAALSTLLPALKKRNKASILEEAISYILQLQKKVETLEKKITIKSCDDVASCSNQSLLSVDTESLALPLIKAKTCNCEVLFSIDCERRKGVLENIVGIIDNLHLSIVSCSVVHFGDSELNITIIAEMGKEYCMSIKEVVNNLHVALKI

XP_057788033.1
MEISAGFNSSADLQYWSWGVDGDCDQEESRPLKQLRASPFGNTNCTLLNSSIDRNLAERNRREKLTRRFAALSTLLPALKKRNKASILEEAISYILQLQKKVETLEKKITIKSCDDVASCSNQSLLSVDTESLALPLIKAKTCNCEVLFSIDCERRKGVLENIVGIIDNLHLSIVSCSVVHFGDSELNITIIAEMGKEYCMSIKEVVNNLHVALKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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