当前解析结果
SmilChr01G004881| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004881 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004881 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004881 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 66889403 - 66893203 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005220 |
|---|---|
| GeneID | 131005220 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005220 |
| 原始查询 | SmilChr01G004881 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OJ1116_C08.104; symbol=OJ1116_C08.104; hit=Os07g0213400; species=rice; confidence=high |
| 产物 | OJ1116_C08.104; symbol=OJ1116_C08.104; hit=Os07g0213400; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G33690 (AT4G33690)G patch domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829511] identity=46.9; qcov=0.881; evalue=1.45e-43; confidence=medium |
| Rice | Os07g0213400 (OJ1116_C08.104)- identity=54.9; qcov=0.845; evalue=7.25e-59; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005220 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788042.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788042.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788042.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788042.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057788042.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:66892436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B29,C12,C30,C83 |
Chr1:66892481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B105,B109,C79,D11 |
Chr1:66892514 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr1:66892689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,D11 |
Chr1:66892695 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B72,C26,C47 |
Chr1:66892892 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B25 |
Chr1:66892892 |
AAC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。