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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004885`

染色体: Chr01 坐标: 66915832-66919325 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004885`
名称	SmilChr01G004885
描述	protein trichome birefringence-like 13
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66915832 - 66919325 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005223`
GeneID	`131005223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005223`
原始查询	`SmilChr01G004885`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 13
产物	protein trichome birefringence-like 13
Arabidopsis	`AT2G14530` (TBL13) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815940] identity=74.5; qcov=0.735; evalue=2.02e-155; confidence=high
Rice	`Os07g0498900` (OsTBL37) - identity=74.1; qcov=0.725; evalue=1.68e-146; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057788046.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057788047.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66916743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A16,B102,B12,B129,B18,B29,B3,B55,B56,B76,B80,B87,B96,C21,C22,C33,C36,C44,C49,C53,C56,C58,C63,C72,D10
`Chr1:66916890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788046.1

413 aa

206

413

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 62-117 aa PF13839 PC-Esterase 118-404 aa

XP_057788047.1

378 aa

189

378

PC-Esterase

PF13839 PC-Esterase 101-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788046.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	62	117	1e-13	52.1	PMR5 N terminal Domain
`XP_057788046.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	118	404	7.9e-70	236.7	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p
`XP_057788047.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	101	369	5.5e-63	214.3	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932063.1
CATTAAAATAAATCTTTAATTGGGGTTAAAAAAATCCAAAGGGAAACTAAGATATTCTGAATGGGAAAAGTGGTGTCGGTGATTCACAGAAGAGGAGGGCCCGAGGCGTGCTAATGTGCGCCCGGGGTAGCGCTCGCGCTAGAGAGCATAAGCCATGGCCACTAGAGCACCGCATCCCGCCTCCAAGAAACTCGTTTCTTCCAATTCTTCACTCGCACCCCGCGCACTTATCTCCCTCCTCTGCGCCGTCTCTCTCTACT...

XM_057932064.1
TCCAATTCTTCACTCGCACCCCGCGCACTTATCTCCCTCCTCTGCGCCGTCTCTCTCTACTTCTGCTTCTCTTTCTTCCGGAAGGATGCGCCGCCGCCCTCGTTATTCTACCCGGTGCTGCCTGCGAAGAGCAGTGGTAACTGCAACTACTCGGACGGCCGCTGGATCTATGATCCATCAGTCAGATCTCCCCCGCGGTATGACCACACGTGCAAGGAGATATTTAAAGGATGGAATTGCATTGGAAGTAACAAATCGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005223
ATGGCCACTAGAGCACCGCATCCCGCCTCCAAGAAACTCGTTTCTTCCAATTCTTCACTCGCACCCCGCGCACTTATCTCCCTCCTCTGCGCCGTCTCTCTCTACTTCTGCTTCTCTTTCTTCCGGAAGGATGCGCCGCCGCCCTCGTTATTCTACCCGGTGCTGCCTGCGAAGAGCAGTGGTAACTGCAACTACTCGGACGGCCGCTGGATCTATGATCCATCAGTCAGATCTCCCCCGCGGTATGACCACACGTGCAA...

LOC131005223
ATGCGCCGCCGCCCTCGTTATTCTACCCGGTGCTGCCTGCGAAGAGCAGTGGTAACTGCAACTACTCGGACGGCCGCTGGATCTATGATCCATCAGTCAGATCTCCCCCGCGGTATGACCACACGTGCAAGGAGATATTTAAAGGATGGAATTGCATTGGAAGTAACAAATCGAACGCCGTCGAGATTCTCAGGTGGCGGTGGAAACCCCACGGCTGCGATCTACCGCCGTTTGATCCCCCACAATTCCTCCAGCAATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788046.1
MATRAPHPASKKLVSSNSSLAPRALISLLCAVSLYFCFSFFRKDAPPPSLFYPVLPAKSSGNCNYSDGRWIYDPSVRSPPRYDHTCKEIFKGWNCIGSNKSNAVEILRWRWKPHGCDLPPFDPPQFLQQFRDTSIGFVGDSLNRNMFVSLFCALRKVSAEVKKWRPAGADRGFTFLKYNLTIAYHRTNLLARYGRWSGGTSGILESLGYKDGYRIDVDIPDGTWAAAPRFHDILIFNTGHWWWAPSKFDPVKSPMLFFEK...

XP_057788047.1
MRRRPRYSTRCCLRRAVVTATTRTAAGSMIHQSDLPRGMTTRARRYLKDGIALEVTNRTPSRFSGGGGNPTAAIYRRLIPHNSSSNFETPALALWIFNSAGFVGDSLNRNMFVSLFCALRKVSAEVKKWRPAGADRGFTFLKYNLTIAYHRTNLLARYGRWSGGTSGILESLGYKDGYRIDVDIPDGTWAAAPRFHDILIFNTGHWWWAPSKFDPVKSPMLFFEKGVPVTPLLAPDAGLAMVLRHMVSFVEKNARKKAIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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