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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004893`

染色体: Chr01 坐标: 66986539-66987399 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004893`
名称	SmilChr01G004893
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66986539 - 66987399 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005232`
GeneID	`131005232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005232`
原始查询	`SmilChr01G004893`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
产物	agamous-like MADS-box protein AGL62
Arabidopsis	`AT5G60440` (AGL62) AGAMOUS-like 62 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836165] identity=47.9; qcov=0.637; evalue=2.6e-43; confidence=medium
Rice	`Os09g0116800` (OsMADS78) - identity=44.1; qcov=0.49; evalue=5.79e-24; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788058.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788058.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788058.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788058.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66986727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr1:66986856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B18
`Chr1:66987277`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	166	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A6,A8,B10,B100,B101,B105,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B124,B127,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B6,B61,B62,B63,B64,B68,B69,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B85,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,C1,C10,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C22,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C5,C53,C54,C56,C57,C58,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C72,C75,C76,C77,C79,C8,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788058.1

259 aa

130

259

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 26-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788058.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	26	73	9e-25	86.6	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932075.1
ATTAAGGCCGCCACACGAAAATCCTTTCCCATAAATAGATACCTGAAACTCGGACAAACAAATCAAATCTTAATTAGAAAGATGAGTTCATCATCGAAGCAAGCTGCAGGGGCGGCGCCAAGAAAGAGCAAAGGCCGGCAGAAAGTGAAGATGGCGAAGATGGAGAACCACAGCAATCTACAAGTGACCTTCTCCAAGCGCCGCGCCGGCCTCTTCAAGAAGGCCAGCGAGCTCTGCACCCTCTGCGGCGCCGAGGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005232
ATGAGTTCATCATCGAAGCAAGCTGCAGGGGCGGCGCCAAGAAAGAGCAAAGGCCGGCAGAAAGTGAAGATGGCGAAGATGGAGAACCACAGCAATCTACAAGTGACCTTCTCCAAGCGCCGCGCCGGCCTCTTCAAGAAGGCCAGCGAGCTCTGCACCCTCTGCGGCGCCGAGGCCGCCATCGTCGTCTTCTCCCCGGCCAACAAGGTCTACTGCTTCGGCCACCCCAACGTCAACACCCTCGTCGACAGGCTGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788058.1
MSSSSKQAAGAAPRKSKGRQKVKMAKMENHSNLQVTFSKRRAGLFKKASELCTLCGAEAAIVVFSPANKVYCFGHPNVNTLVDRLAAGMEPPPPPSHLIMEAHRNSNIRDLNIELTRLDTLLRAERRRAQEIDLLRRAGHQQRSLDDLDHAQLCALKESVMEFKKSLDAKLHKEMFNSHPSGVGAGADDTCRFPGFDLPKLSLGFGHLLPYSNGGLPADYSTVNINGGGGAYYGWSNGASSSTLPNDPHAIATNMFQMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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