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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004906`

染色体: Chr01 坐标: 67109976-67110610 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004906`
名称	SmilChr01G004906
描述	phytosulfokines-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67109976 - 67110610 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005245`
GeneID	`131005245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005245`
原始查询	`SmilChr01G004906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytosulfokines-like
产物	phytosulfokines-like
Arabidopsis	`AT2G22860` (PSK2) phytosulfokine 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816817] identity=35.2; qcov=1.13; evalue=1.35e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0675600` (OsPSK5) - identity=36.2; qcov=1.03; evalue=6.83e-06; confidence=low
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0008083 (growth factor activity); GO:0008283 (cell population proliferation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06404 (PSK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788099.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788099.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788099.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788099.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67110212`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C33
`Chr1:67110212`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C33
`Chr1:67110222`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,A14,A16,A19,A22,B102,B80,B98,C21,C37,C44,C56
`Chr1:67110225`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,A14,A16,A19,A22,B102,B80,B98,C21,C37,C44,C56
`Chr1:67110250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788099.1

80 aa

PSK

PF06404 PSK 38-79 aa

XP_057788100.1

78 aa

PSK

PF06404 PSK 38-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788099.1`	Pfam	`PF06404`	PSK	Family	38	79	2.6e-11	45.1	Phytosulfokine precursor protein (PSK)
`XP_057788100.1`	Pfam	`PF06404`	PSK	Family	38	77	6.6e-11	43.8	Phytosulfokine precursor protein (PSK)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932117.1
GGTTTAACTTTTTGGATATATCCAACTAAAAGTTTCCAAGAGAGTTAATCCAATTTCCATGAAAAAATAAAGGCGCAGCACCCTTGTAGCCACGCTATTATCTCAACTTCTTGGCCGTCCGAATATAATTTTCCAACGTTAATTATGGACCCTTCTCCATCTACATATACACCTAATTAATTTGAGTTAGAGCTTAATTACTCAGAAATTTGAGCAGCATGGCCAAAACCACCACCACACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTT...

XM_057932116.1
CGTCCGAATATAATTTTCCAACGTTAATTATGGACCCTTCTCCATCTACATATACACCTAATTAATTTGAGTTAGAGCTTAATTACTCAGAAATTTGAGCAGCATGGCCAAAACCACCACCACACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAGCAGTGGACGTCCTCGGCCGGCCGGGCCCCGCATTTCACGACGTCACTCCCATAGAAAATCATCACGCGGAACAGGAGGGGCAGGCCGCGGAGGATCGAGATAACTGCGTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005245
ATGGCCAAAACCACCACCACACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAGCAGTGGACGTCCTCGGCCGGCCGGGCCCCGCATTTCACGACGTCACTCCCATAGAAAATCATCACGCGGAACAGGAGGGGCAGGCCGCGGAGGATCGAGATAACTGCGTGGGATTGAGAGAAGATGAGTGCATGATGAAGAGAACAGTTGAAGCACAACTTGATTATATCTACACGCAGAAGAAGAAGCACCCCTGA

LOC131005245
ATGGCCAAAACCACCACCACACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAGCAGTGGACGTCCTCGGCCGGCCGGGCCCCGCATTTCACGACGTCACTCCCATAGAAAATCATCACGCGGAGGGGCAGGCCGCGGAGGATCGAGATAACTGCGTGGGATTGAGAGAAGATGAGTGCATGATGAAGAGAACAGTTGAAGCACAACTTGATTATATCTACACGCAGAAGAAGAAGCACCCCTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788099.1
MAKTTTTLLLLLLLLAVDVLGRPGPAFHDVTPIENHHAEQEGQAAEDRDNCVGLREDECMMKRTVEAQLDYIYTQKKKHP

XP_057788100.1
MAKTTTTLLLLLLLLAVDVLGRPGPAFHDVTPIENHHAEGQAAEDRDNCVGLREDECMMKRTVEAQLDYIYTQKKKHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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