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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004915`

染色体: Chr01 坐标: 67180111-67184533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004915`
名称	SmilChr01G004915
描述	serine carboxypeptidase-like 18
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67180111 - 67184533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005256`
GeneID	`131005256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005256`
原始查询	`SmilChr01G004915`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 18
产物	serine carboxypeptidase-like 18
Arabidopsis	`AT1G33540` (scpl18) serine carboxypeptidase-like 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840248] identity=49.1; qcov=0.941; evalue=6.81e-139; confidence=high
Rice	`Os04g0176400` (OsSCP22) - identity=46.4; qcov=0.93; evalue=7.66e-131; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups); GO:0019748 (secondary metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788112.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057788112.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788112.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788112.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67180361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:67180396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:67181795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B99,C31
`Chr1:67181954`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr1:67181954`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr1:67181957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr1:67182359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C63
`Chr1:67182379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:67182547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:67182551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:67182574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C15
`Chr1:67182574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788112.1

470 aa

235

470

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 35-465 aa

XP_057788113.1

470 aa

235

470

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 35-465 aa

XP_057788114.1

457 aa

228

457

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 35-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788112.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	35	465	7.3e-124	415.0	Serine carboxypeptidase
`XP_057788113.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	35	465	7.3e-124	415.0	Serine carboxypeptidase
`XP_057788114.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	35	444	3.8e-112	376.5	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095239.1
CAGTCTTCCGTGGCTTGTTATGAGCAATGTCCCCACTCTTAACAATATCAGCCACTCAAACATAAATTATTAACCATAAACACACGTATTAATCAAATTTTTTTTAATGTACGTATCTATCAATTTATTATAGCAGTCACTTTATACTTTTCTCTTTTTGGTTTTTGTTTCTGCACCGCAGCAACGACATGTCGCAGCCGCATCTCCGGCAACTCCTCCTCTCATTCAACTTGATGCTTTTGCTAACGGCCGCTTTCTTC...

XM_057932130.1
CTACAAAAATACAGATGAATGATAGTAGTATCTGATTTCAGTCTTCCGTGGCTTGTTATGAGCAATGTCCCCACTCTTAACAATATCAGCCACTCAAACATAAATTATTAACCATAAACACACCAACGACATGTCGCAGCCGCATCTCCGGCAACTCCTCCTCTCATTCAACTTGATGCTTTTGCTAACGGCCGCTTTCTTCACAACTACGCACTCCGTGATTCAGAACCTCCCAGGTTTCAACGGCACATTTCCCTTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131005256
ATGTCGCAGCCGCATCTCCGGCAACTCCTCCTCTCATTCAACTTGATGCTTTTGCTAACGGCCGCTTTCTTCACAACTACGCACTCCGTGATTCAGAACCTCCCAGGTTTCAACGGCACATTTCCCTTCAAACTCCAAACAGGGTATATTGGCGTGGGAGAATCGGAGCAAGTACAGCTATTCTACTACTTCATTGAGTCTGAACGGAGCCCTGCAAACGACCCTCTTCTTCTCTGGCTCACCGGCGGCCCCGGCTGCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057788112.1
MSQPHLRQLLLSFNLMLLLTAAFFTTTHSVIQNLPGFNGTFPFKLQTGYIGVGESEQVQLFYYFIESERSPANDPLLLWLTGGPGCSGFSGLVYEIGPLVFDYDNSDGIIPTLVLNPYSWTKVANIIFIDQPAGTGFSYATTAEAYKSSNTLSAIHTYQFLQKWLLNHPKFLNNPLYIAGDSYSGITVPLVVNQVYGGIEAGRNPVLNLKGYILGNPLTQTYANYNGRVAYAHRMGLLSDELYQSAKENCYGYYLSVDPS...

XP_057788113.1
MSQPHLRQLLLSFNLMLLLTAAFFTTTHSVIQNLPGFNGTFPFKLQTGYIGVGESEQVQLFYYFIESERSPANDPLLLWLTGGPGCSGFSGLVYEIGPLVFDYDNSDGIIPTLVLNPYSWTKVANIIFIDQPAGTGFSYATTAEAYKSSNTLSAIHTYQFLQKWLLNHPKFLNNPLYIAGDSYSGITVPLVVNQVYGGIEAGRNPVLNLKGYILGNPLTQTYANYNGRVAYAHRMGLLSDELYQSAKENCYGYYLSVDPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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