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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004928`

染色体: Chr01 坐标: 67346163-67348828 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004928`
名称	SmilChr01G004928
描述	uncharacterized SmilChr01G004928
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67346163 - 67348828 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005269`
GeneID	`131005269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005269`
原始查询	`SmilChr01G004928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377]; symbol=AT5G52980; hit=AT5G52980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377]; symbol=AT5G52980; hit=AT5G52980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G52980` (AT5G52980) ER-based factor for assembly of V-ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835377] identity=64.8; qcov=0.896; evalue=5.49e-83; confidence=high
Rice	`Os02g0225300` - identity=41.1; qcov=0.252; evalue=5e-10; confidence=weak
GO	GO:0012505 (endomembrane system); GO:0070072 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF11712 (Vma12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057788136.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057788136.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057788136.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788136.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788136.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67346413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:67346518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:67346677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr1:67347590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67347652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67347790`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B124
`Chr1:67347790`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B124
`Chr1:67347937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B111,B57,D4
`Chr1:67347955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C51
`Chr1:67348063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788136.1

222 aa

111

222

Vma12

PF11712 Vma12 82-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788136.1`	Pfam	`PF11712`	Vma12	Family	82	189	1.1e-07	32.6	Endoplasmic reticulum-based factor for assembly of V-ATPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932153.1
GCTCATTGCCATCTCTAGTGACAATTGGTAGAGATATACAAGCATAACTCATGTCTCATGCAATTTATCTGAAATAAATTGAATAAAAATATGGAGTAATTGGTTTTGAATTTGCGGAAGATAAAGGGAATTAGAATTGTTTGTTGATTCTTGAGCAAATTCTGTGAAAGGGGAACACGAAATAGAATTACGATGGTCACAGAAGCCAACGGCGCCGTTTCCCCCGAACTGTCAACCACCGCCGGCGGAGGCGGCCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005269
ATGGTCACAGAAGCCAACGGCGCCGTTTCCCCCGAACTGTCAACCACCGCCGGCGGAGGCGGCCTTATCATATCAGTTACAGATGCGATGCGCTCCTTCCTCACCACATCTTCCACCGATCCACATCTATCGGAGGATCTCAGACACCTTTCTTCCTCGCTTAGCCTCCAGTCCACCGCACCCTATCAATCCCTAAAAACGATCTGGTTCGGATCCGAATCCGGTTCCAGACCCGATTTATCCTCTCTCCTCGCCGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788136.1
MVTEANGAVSPELSTTAGGGGLIISVTDAMRSFLTTSSTDPHLSEDLRHLSSSLSLQSTAPYQSLKTIWFGSESGSRPDLSSLLAGSNFVFTSPPPRQKSEELKARLRKLEEAAERKAYDELVKDITPKKPVNEPFSSYKDQLGFGLHVVVTMFTGYLVGYAAFRALFGQSAPLSAAGGILGLVGAMLVETLLFILRSSDLGGESSSSSASRPSNLKIKKNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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