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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004933`

染色体: Chr01 坐标: 67402173-67403677 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004933`
名称	SmilChr01G004933
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67402173 - 67403677 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011918`
GeneID	`131011918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011918`
原始查询	`SmilChr01G004933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
产物	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
Arabidopsis	`AT5G62220` (GT18) glycosyltransferase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836343] identity=52.3; qcov=0.843; evalue=1.2e-162; confidence=high
Rice	`Os04g0574100` - identity=44.5; qcov=0.862; evalue=2.34e-126; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0008378 (galactosyltransferase activity); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057795804.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057795804.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795804.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795804.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795804.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67402179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B119,B2,B52,B91
`Chr1:67402610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:67402619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:67402695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:67402821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67402891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B3,C39,C83
`Chr1:67402913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B12,B52,B55
`Chr1:67403097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:67403230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:67403328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C31
`Chr1:67403337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:67403383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C2,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795804.1

472 aa

236

472

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 71-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795804.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	71	410	1.2e-69	235.6	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939821.1
CCAAAACTAAAATAAAATAGAGGAAACTAAAAAATATTGGTGGAATTTTCTAAACCACCACACCTCCACCGCCGGCGCCACCCTCCATGCTGCCTACCACCACCGCCCCTCCGCCCGACGACCACCACCACCCCTCGAAGAAATCGAAACTGATCAAAACCAGCGTCCACACCATCAAATCCAACATCTCGGCCCACCCCTATGCATGGCTCGCCCTCACCATCTTCCTCCAGCTACTCATCATCCCCTACATGCTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011918
ATGCTGCCTACCACCACCGCCCCTCCGCCCGACGACCACCACCACCCCTCGAAGAAATCGAAACTGATCAAAACCAGCGTCCACACCATCAAATCCAACATCTCGGCCCACCCCTATGCATGGCTCGCCCTCACCATCTTCCTCCAGCTACTCATCATCCCCTACATGCTCCCCCCTTTCCGCTTCGACTCTGTCTTCTCCGATGAAGCCTGCAAACACGGCAGCATTTACGTCTACGACCTCCCCCCCATGCTCAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795804.1
MLPTTTAPPPDDHHHPSKKSKLIKTSVHTIKSNISAHPYAWLALTIFLQLLIIPYMLPPFRFDSVFSDEACKHGSIYVYDLPPMLNKDLLRNCHDLDPWVSLCDAVSNAGLGRPATGLPASVVPPNLSAAWYWTDMYAAEVIYHDRLNSYRCTTSNPAQATAFYIPFYAGLAVRKYLWPNYTSEDRDFHAAAMLDWVKNQAPWRRSNGSDHFLMLGRLTWDFRRLTDDDGDWGTRLIYMPLMKNVLRLTVERSRWDDLEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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