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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G004940

染色体: Chr01 坐标: 67513488-67521546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G004940
名称SmilChr01G004940
描述QWRF motif-containing protein 2
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向67513488 - 67521546 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131005278
GeneID131005278
locus_tag-
NCBI NameLOC131005278
原始查询SmilChr01G004940

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述QWRF motif-containing protein 2
产物QWRF motif-containing protein 2
ArabidopsisAT1G49890 (QWRF2)
QWRF motif protein (DUF566) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841412]
identity=47.8; qcov=1.04; evalue=3.66e-165; confidence=high
RiceOs03g0762900
-
identity=37.3; qcov=0.942; evalue=3.14e-71; confidence=medium
GOGO:0005737 (cytoplasm); GO:0005813 (centrosome); GO:0005880 (nuclear microtubule); GO:0007098 (centrosome cycle); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0051225 (spindle assembly)
KEGG-
PfamPF04484 (QWRF)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131005278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoskeleton 细胞骨架 1.00000 XP_057788157.1
2 Nucleus 细胞核 0.60000 XP_057788157.1
3 Nucleus membrane 核膜 0.20000 XP_057788157.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057788157.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057788157.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr1:67513854 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C53
Chr1:67514323 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B31,B34,B38,B39,B70
Chr1:67517841 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C75
Chr1:67518007 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B23,B28,B94,C39
Chr1:67518029 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B104
Chr1:67518285 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr1:67518371 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B82,B99,C52,C86
Chr1:67518398 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C48
Chr1:67518738 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788157.1
660 aa
N
1
330
660
QWRF
C
PF04484 QWRF 305-618 aa
XP_057788158.1
660 aa
N
1
330
660
QWRF
C
PF04484 QWRF 305-618 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057788157.1 Pfam PF04484 QWRF Family 305 618 2.4e-105 353.2 QWRF family
XP_057788158.1 Pfam PF04484 QWRF Family 305 618 2.4e-105 353.2 QWRF family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057932174.1
CAACTTTCTTCAAATATATATGTATATGAATACCAATAAAAAAAAATGTCAATGTATTTGCAAGAACATCCCCCTCTTTGACTTGACTTTCAATTTCCTCAGATGGGCTGCTGTATTGCGGCGTCTGACATTCAAAAAAGAAGAAGAAACAACGAAAAGGAAATCTTGAAGCAAAAAAGGTGGAATCTTTTGCAGACCCATCATGCATTCTTGAGCTACAGTGGGATCTCTTGATCTTTCTTGCAGATGAAAATGCGAGG...
XM_057932175.1
TATTAGTTTAATCATAGATGTAATAAAAGTAAAATTATACAATTTAATAAACCACCTTAATTGACATTATTAGAATTTTTAATAATTAATATTTGCACAATTAAATTTAAAAAATTGAAAAAACAATTAATGATGGAACACGAGTGAAACACTTAAATAACATAAATGATTCCAAGTGAGTATATGTAATGTCATTATCACCATATATACACACAAATACTTACATTTTTGTGAGGAAATATAATGTTTTCTACATCTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131005278
ATGTGTATTCTTGAATTTGTGATGATGGTGGCTGCTGTTTCCGGAGCAGCTTCGACAACCGCCCCCCAAAACCCCAAAACTACCGCTTCCCACCACGAGCACGGCCGAAGGCCGCCATTGCTGCCCTCTGAAAAGGATAACAGCAATGGGATTTCGAACAACCCTAAAAAGCCCAAATCAAGAATTGTGTCTTCTAGATACATGTCCCCTTCAACTTCCACCTCCACTTCAAATTCCTCTTCACTCTCCTCTTCCTCGTC...
LOC131005278
ATGTGTATTCTTGAATTTGTGATGATGGTGGCTGCTGTTTCCGGAGCAGCTTCGACAACCGCCCCCCAAAACCCCAAAACTACCGCTTCCCACCACGAGCACGGCCGAAGGCCGCCATTGCTGCCCTCTGAAAAGGATAACAGCAATGGGATTTCGAACAACCCTAAAAAGCCCAAATCAAGAATTGTGTCTTCTAGATACATGTCCCCTTCAACTTCCACCTCCACTTCAAATTCCTCTTCACTCTCCTCTTCCTCGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057788157.1
MCILEFVMMVAAVSGAASTTAPQNPKTTASHHEHGRRPPLLPSEKDNSNGISNNPKKPKSRIVSSRYMSPSTSTSTSNSSSLSSSSSSSRRFPSPVVSRNSTPLPNAPSLTSKRSVSVDRRRQGVSRPLTPDFDPKNGNVSAATKLLVTSTRSLSVSFQGEAFSLPISKTKVAPPSPNLTSVRKGTPERRRSSTPSRGKADIVDSCKLADQHRWPARHRLMNPLSRSLECSGNVEDRSSLSGSVSAVRSLQHSMIDERRP...
XP_057788158.1
MCILEFVMMVAAVSGAASTTAPQNPKTTASHHEHGRRPPLLPSEKDNSNGISNNPKKPKSRIVSSRYMSPSTSTSTSNSSSLSSSSSSSRRFPSPVVSRNSTPLPNAPSLTSKRSVSVDRRRQGVSRPLTPDFDPKNGNVSAATKLLVTSTRSLSVSFQGEAFSLPISKTKVAPPSPNLTSVRKGTPERRRSSTPSRGKADIVDSCKLADQHRWPARHRLMNPLSRSLECSGNVEDRSSLSGSVSAVRSLQHSMIDERRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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