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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004955`

染色体: Chr01 坐标: 67638247-67640696 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004955`
名称	SmilChr01G004955
描述	uncharacterized SmilChr01G004955
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67638247 - 67640696 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005294`
GeneID	`131005294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005294`
原始查询	`SmilChr01G004955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19540` (AT3G19540) glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490] identity=71; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0591100` (OJ1174_G05.24) - identity=64.6; qcov=1.11; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788173.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788173.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788173.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057788173.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057788173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67638778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:67638797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:67638813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B53,C42
`Chr1:67638906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:67639086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B140,B94,C38,C71
`Chr1:67639152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:67639705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C44
`Chr1:67640033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr1:67640038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67640070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:67640105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:67640182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788173.1

469 aa

234

469

DUF620

PF04788 DUF620 180-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788173.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	180	421	1.7e-120	401.7	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932190.1
AAAAGCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCACACAACACACACTATCCCTCATCTCTCCCACCAGTCGCTTTCTCACTACTTTCTCTCTCTAAATAAACGCAACTACCTTGGCTTAATCAACCCTCACACACACTTCTCTACTCATTCGTTCCCCCATTTCTTCTCTAACTAAAAATCACTCTCTCTACTGCCAAAATTCTTAACAGAAAAAACTCTCACGAAAATATGGCACTCGCCCCATCACGTAATCCCTATTTCATATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005294
ATGGAGAGGAAGCAGGGACAGGGGTTTTTCTCGGCTTTAGAGGACGTGGTGCGCGGCCTATCTCCAGCGAGGTCGCGGGGGAAGAGCCCCGGCCGGAGCAGGTCGCCGATGTCGGGCCTGCTCCGGCGGAAAGTCGGCGCCAGCAACTCCGACTCCTTGATTGCGAGATCGGGCAGCCTCAGGCCCATGGGAGAGACGCTCACGCCGCTGATGGAGGGTCCGGATCCGGACGGAGAGGAAATCGGCGACTCCAAGCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788173.1
MERKQGQGFFSALEDVVRGLSPARSRGKSPGRSRSPMSGLLRRKVGASNSDSLIARSGSLRPMGETLTPLMEGPDPDGEEIGDSKRLGSGLGQWVRGQLTRNPSVAVNDSGGGGRRSDLRLLLGVMGAPLAPVHVSASDPLPHLSIKDTPIETSSAQYIVQQYTAASGGQKVQNAVKNAYAMGKVKMVASEFETATKVVKNRNVSRAAESGGFVLWQMSPDMWYVELAVGGSKVHAGCNGKLVWRHTPWLGAHTAKGPVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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