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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004959`

染色体: Chr01 坐标: 67687647-67692378 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004959`
名称	SmilChr01G004959
描述	WD repeat-containing protein 55
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67687647 - 67692378 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005298`
GeneID	`131005298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005298`
原始查询	`SmilChr01G004959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat-containing protein 55
产物	WD repeat-containing protein 55
Arabidopsis	`AT2G34260` (WDR55) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817987] identity=70.1; qcov=1.01; evalue=5.31e-175; confidence=high
Rice	`Os07g0660700` (OsWD40-149) - identity=60.2; qcov=1.03; evalue=1.84e-156; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF24796 (WDR55)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788181.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057788181.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057788181.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057788181.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057788181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67688632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:67688755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:67690906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:67691383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:67691799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B119,B2,B52,B91
`Chr1:67691852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:67691854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B140,B94,C38,C71
`Chr1:67692238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B9,C38,C64
`Chr1:67692256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B119,B2,B52,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788181.1

351 aa

176

351

WDR55

WD40

PF24796 WDR55 2-294 aa PF00400 WD40 93-121 aa PF00400 WD40 126-161 aa PF00400 WD40 259-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788181.1`	Pfam	`PF24796`	WDR55	Repeat	2	294	1.1e-99	334.0	WDR55
`XP_057788181.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	93	121	7.7e-21	74.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788181.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	126	161	7.7e-21	74.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788181.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	259	291	7.7e-21	74.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932198.1
CTCCGGCGGCGGCAGTCCCTTTGGCCTTTGAAAGATCATACTTTTTTATTGGAAAATGGAGATTGATTTGGAAAAGCTTCCGTTTGATCTCGACTTCCATCCATCAACTAATCTCGTCGCCGCCGGTCTCATTACCGGCCATCTCCTACTGTACCGTTATGATGCTGAAGCTACGCCTCAAAGGTTGCTGGAAGTGAATGCTCATACCGAATCATGTAGGGCTCTCCGTTTCGTCAACGAAGGACGTGCTATAGTCACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005298
ATGGAGATTGATTTGGAAAAGCTTCCGTTTGATCTCGACTTCCATCCATCAACTAATCTCGTCGCCGCCGGTCTCATTACCGGCCATCTCCTACTGTACCGTTATGATGCTGAAGCTACGCCTCAAAGGTTGCTGGAAGTGAATGCTCATACCGAATCATGTAGGGCTCTCCGTTTCGTCAACGAAGGACGTGCTATAGTCACCGGGTCTCCAGATTTTTCCATTCTTGCGACAGATGTCGAAACTGGTGCGGCAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788181.1
MEIDLEKLPFDLDFHPSTNLVAAGLITGHLLLYRYDAEATPQRLLEVNAHTESCRALRFVNEGRAIVTGSPDFSILATDVETGAAIARLDNSHGAAVNRIVNLTESTIASGDDEGCIKVWDTRQRTCCNTLNVHEEYISDMTFASDSMKLIGTSGDGTLSVCNLRSNKVQTRSEFSEDELLSVVIMKNGRKVICGTQSGTLLLYSWGFFKDCSDRFVDLSPNSVDAMLKLDEERLITGSENGIISLVGILPNRIIQPIAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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