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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004975`

染色体: Chr01 坐标: 67826311-67826811 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004975`
名称	SmilChr01G004975
描述	uncharacterized SmilChr01G004975
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67826311 - 67826811 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011986`
GeneID	`131011986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011986`
原始查询	`SmilChr01G004975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816011]; symbol=AT2G15220; hit=AT2G15220; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816011]; symbol=AT2G15220; hit=AT2G15220; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G15220` (AT2G15220) Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816011] identity=30.3; qcov=1.22; evalue=5.58e-15; confidence=low
Rice	`Os10g0490800` - identity=30.5; qcov=1.04; evalue=2.51e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04450 (BSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057795880.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795880.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795880.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795880.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67826428`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A16,B102,B106,B115,B126,B134,B138,B18,B3,B61,B80,B98,C13,C21,C41,C44,C56
`Chr1:67826449`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A20,A23,A4,B11,B118,B45,B6,B62,B68,B69,B86,B9,B90,B92,C25,C27,C42,C47,C52,C61,C7,C71,C72,C74,C76,C77,D1
`Chr1:67826651`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B17,B4,B95,C36
`Chr1:67826651`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B17,B4,B95,C36
`Chr1:67826742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B66,C31,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795880.1

135 aa

135

BSP

PF04450 BSP 23-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795880.1`	Pfam	`PF04450`	BSP	Family	23	75	8.7e-14	52.5	Peptidase of plants and bacteria

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939897.1
ATGAAAGCACCCCATTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTGCAACTCCTCCCGTATTTCCCGGCCATCGCCGCCGTCAAATACGTGGCCTACAACGACGCGAAGAACACTCCGGGAGGGGCGAGGTTCGAGAAGGAGATCGGAGTCCCGTACACGCTAAAGATCATGCGCGACATCAACAACTTCGTGTGGGACACTTTTCAGCAGCACAGCGAAGCCGACCGGAAACAGGGCTACCAAGGGAACCTCAAGTCTCTCCTCTACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011986
ATGAAAGCACCCCATTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTGCAACTCCTCCCGTATTTCCCGGCCATCGCCGCCGTCAAATACGTGGCCTACAACGACGCGAAGAACACTCCGGGAGGGGCGAGGTTCGAGAAGGAGATCGGAGTCCCGTACACGCTAAAGATCATGCGCGACATCAACAACTTCGTGTGGGACACTTTTCAGCAGCACAGCGAAGCCGACCGGAAACAGGGCTACCAAGGGAACCTCAAGTCTCTCCTCTACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795880.1
MKAPHFFFLLLLQLLPYFPAIAAVKYVAYNDAKNTPGGARFEKEIGVPYTLKIMRDINNFVWDTFQQHSEADRKQGYQGNLKSLLYHELTHVFQWNGEGQAEYMILKANYYPPGWGRGGIRAMISRLGFWSTARG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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