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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004978`

染色体: Chr01 坐标: 67838399-67842346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004978`
名称	SmilChr01G004978
描述	triacylglycerol lipase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67838399 - 67842346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005314`
GeneID	`131005314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005314`
原始查询	`SmilChr01G004978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	triacylglycerol lipase 1
产物	triacylglycerol lipase 1
Arabidopsis	`AT2G15230` (LIP1) lipase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816012] identity=63.6; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0103100` - identity=58.7; qcov=0.973; evalue=4.8e-177; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF04083 (Abhydro_lipase); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057788199.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057788199.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057788199.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788199.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788199.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67838775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:67841136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67841714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:67841790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B25,B73
`Chr1:67841926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:67842075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788199.1

406 aa

203

406

Abhydro_lipase

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF04083 Abhydro_lipase 47-103 aa PF00561 Abhydrolase_1 86-209 aa PF12697 Abhydrolase_6 88-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788199.1`	Pfam	`PF04083`	Abhydro_lipase	Family	47	103	2.8e-14	53.1	Partial alpha/beta-hydrolase lipase region
`XP_057788199.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	86	209	2.1e-12	48.0	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057788199.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	88	218	7.1e-07	30.8	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932216.1
AGATCAGGTCCGACTGAAATTGGGCCTAAAAATCAAAATAAAAATTGGGAGCCCATTTCCGCACCTAATTATGGCAGCTTATACTCTCTCTCTCTTTTCGCACGTGCTGTTTGGAGCAACGCGCCGTTGCAGCGCGTGACTTAAGATTTCGCACCACACTGCAAATTGCTTAGATATTGTAACTGAAGATTTCAACGCACTCCCAACTGATACAACTAGGTGGTGGTTGGTGGAGATCTCTTCCCGCCATCGCCTCCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005314
ATGGAGTTCCCGGCAGTGGCGATCGACGTGACGGTGGCGCTATTCATTTTGTTCGCATCTACCGCAGTTTATTCAACTCAAGACTTTGCCGTCGCCTCGAAGCTCCGCTTCAAGTCGTCCACAGCCGGTCTTTGCGCTAATGTCATCGAGCCTTCTGGATTCCCTTGCACCGAACACACTACTCGGACAAAAGATGGATATGTATTGGGACTTCAGCGTGTTACATCTCCTTCCGTAACTGTGCAGGAATGGACCCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788199.1
MEFPAVAIDVTVALFILFASTAVYSTQDFAVASKLRFKSSTAGLCANVIEPSGFPCTEHTTRTKDGYVLGLQRVTSPSVTVQEWTPPVLLIHGLFMAGDAWFLDSPNQSLGFILANHGYDVWVGNVRGTHWSHGHVSLSEEDKEFWDWSWQELALYDLGEMINYIYLTTNSKVLVVGHSQGTIMSLAALTQPDIAKMVKGAALLCPISYLEHITAPFVLRLVKMRLDEVILALGIHELNFKSNWGTRIMDMMCDGHLDCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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