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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004979`

染色体: Chr01 坐标: 67844031-67848404 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004979`
名称	SmilChr01G004979
描述	uncharacterized SmilChr01G004979
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67844031 - 67848404 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012004`
GeneID	`131012004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012004`
原始查询	`SmilChr01G004979`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795899.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057795899.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057795899.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795899.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795899.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67846675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:67846803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C59
`Chr1:67846813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C52
`Chr1:67846823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C57,C59
`Chr1:67846838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr1:67846858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:67846869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B138,C3
`Chr1:67846878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr1:67846878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67846887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B59,B8,C71
`Chr1:67846904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C17
`Chr1:67846922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795899.1

974 aa

487

974

DUF8566

DUF1985

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 59-236 aa PF09331 DUF1985 81-215 aa PF02902 Peptidase_C48 821-963 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795899.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	59	236	3e-08	34.4	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057795899.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	81	215	2e-11	44.7	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057795899.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	821	963	3.2e-06	27.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939916.1
ATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAGACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGATCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCGCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012004
ATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAGACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGATCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCGCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795899.1
MASSSQANVPYLRRDTIDQTEVAISTYYRDSHFPDLVETLNVVGEQCNSDLLGRFRASCFGHFTDWRPGAKSNKALHQIVSRQIVSEENEMCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGARSMTIQSLIKRVCDLDRRVDDEDGSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDARVQPWLWVLVDDLAAFDRFPWGAYSYKMLCHYTRETGKGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGFGHMVAASSGDPTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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