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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004990`

染色体: Chr01 坐标: 67924853-67927229 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004990`
名称	SmilChr01G004990
描述	uncharacterized SmilChr01G004990
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67924853 - 67927229 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005325`
GeneID	`131005325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005325`
原始查询	`SmilChr01G004990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837942]; symbol=AT1G13810; hit=AT1G13810; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837942]; symbol=AT1G13810; hit=AT1G13810; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G13810` (AT1G13810) Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837942] identity=49.4; qcov=0.743; evalue=2.41e-81; confidence=high
Rice	`Os08g0236700` - identity=40.5; qcov=0.743; evalue=1.02e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09588 (YqaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057788217.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788217.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788217.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788217.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67925318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:67925348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:67925419`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr1:67925419`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr1:67925492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67925728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67925819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:67925858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D11
`Chr1:67926039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:67926101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C1,C26,C43
`Chr1:67926433`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B21,B74,B76,B87,B89,B99,C22,C29,C34,C52,C61,C72,C78,C79,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788217.1

346 aa

173

346

YqaJ

PF09588 YqaJ 95-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788217.1`	Pfam	`PF09588`	YqaJ	Domain	95	234	1.2e-15	58.8	YqaJ-like viral recombinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932234.1
ACCAAAATAAAAATCTAAGCCCAAAACCGCCCAACTCTTTCTCTGTCTCTTTCCCAGTTGAGTTCCCCTCACTACTCACGCAGACAGAAGCATCAAACAGCGCTTCTCCTCTTCGATTCTTATTTATTTGCCTTTTTTACCTCCCGGAACAACCCGCCGCTCGACGCCGCCAAGCGGAAGTTGCCGCGTCGCCGTCCTCTGTACTTTCTATCTGCCGCTTCCACTAGAAGCTCGACGGAATAGCCGCGCCGAAACAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005325
ATGTACATGACTCTACATGTGAATTGTTTGCAGATAGCAAAGCTACTTGTTTTGATGGCTACTTGTTCTGATGGTGGTGCACGATTGATGAAGAACTTGAAAAAATGTATTTCTTCTGTTGGATATTCTGAATTTAACAAGAATATCTCCAACTTCGAGAAGGTGACAACTTCTTTGATCTACGGAAACTTGAGGAGGTACAGTGGCTGCCCAACTCTTGAAAGTTTTCGTAGCAAAACTCATCCTGTTCTTCAATCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788217.1
MYMTLHVNCLQIAKLLVLMATCSDGGARLMKNLKKCISSVGYSEFNKNISNFEKVTTSLIYGNLRRYSGCPTLESFRSKTHPVLQSSDLQQWFKNWQHLRKDKLTASTFALAIGLWPRGRTRLWLEKLGTIEPFSGNLATTWSNIKEKEALERYQWITGNKIWYPEFQVYGEKNPADNWLAASPDGAIDSYIYGLPSRGVLEIKCPFFGGDRSRAEPWKRVPLHYIPQAQGLMEILDRDWLDMYVWTVKGSSLFRIYRNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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